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Dynamic conformational flexibility and molecular interactions of intrinsically disordered proteins.

Tytuł:
Dynamic conformational flexibility and molecular interactions of intrinsically disordered proteins.
Autorzy:
Bhattarai A; Bioinformatics Programming Laboratory, Department of Biotechnology, School of Biosciences and Technology, Vellore Institute of Technology, Vellore 632 014, India.
Emerson IA
Źródło:
Journal of biosciences [J Biosci] 2020; Vol. 45.
Typ publikacji:
Journal Article; Review
Język:
English
Imprint Name(s):
Publication: <2006- >: New Delhi : Springer India, in co-publication with Indian Academy of Sciences
Original Publication: [Bangalore] : Indian Academy of Sciences, 1979-
MeSH Terms:
Protein Conformation*
Protein Stability*
Intrinsically Disordered Proteins/*chemistry
Intrinsically Disordered Proteins/*metabolism
Drug Delivery Systems ; Protein Binding ; Protein Domains ; Protein Folding
References:
Science. 2008 Feb 15;319(5865):916-9. (PMID: 18276881)
ACS Chem Biol. 2015 Mar 20;10(3):795-802. (PMID: 25511246)
Anal Chem. 2012 Mar 6;84(5):2096-104. (PMID: 22242801)
Neurotherapeutics. 2012 Apr;9(2):464-76. (PMID: 22373667)
Nat Rev Drug Discov. 2002 Sep;1(9):696-709. (PMID: 12209150)
Nucleic Acids Res. 2016 Jun 2;44(10):4835-45. (PMID: 27105849)
Molecules. 2013 Sep 04;18(9):10802-28. (PMID: 24008243)
Int J Neuropsychopharmacol. 2014 Jan;17(1):117-26. (PMID: 24103729)
RNA Biol. 2017 Jul 3;14(7):926-937. (PMID: 28418268)
Annu Rev Biophys. 2008;37:215-46. (PMID: 18573080)
Nucleic Acids Res. 2012 Jan;40(Database issue):D507-11. (PMID: 22067451)
Nature. 2011 Jul 20;475(7356):324-32. (PMID: 21776078)
Curr Opin Struct Biol. 2013 Oct;23(5):748-54. (PMID: 23835228)
Nucleic Acids Res. 2017 Jan 4;45(D1):D219-D227. (PMID: 27899601)
Mol Cell. 2015 Mar 5;57(5):936-947. (PMID: 25747659)
Biochemistry. 2018 May 1;57(17):2478-2487. (PMID: 29517898)
Sci Rep. 2019 Feb 7;9(1):1575. (PMID: 30733475)
Biochem Biophys Res Commun. 2009 May 8;382(3):479-82. (PMID: 19265676)
Bioinformatics. 2018 Feb 1;34(3):535-537. (PMID: 29385418)
JAMA Neurol. 2018 Oct 1;75(10):1206-1214. (PMID: 29913017)
Proc Natl Acad Sci U S A. 2008 Apr 15;105(15):5762-7. (PMID: 18391200)
Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Jun 9;112(23):7189-94. (PMID: 26015579)
Curr Opin Struct Biol. 2011 Jun;21(3):432-40. (PMID: 21514144)
Nat Commun. 2014 Dec 19;5:5857. (PMID: 25524885)
Nature. 2013 Jun 20;498(7454):390-4. (PMID: 23783631)
ACS Chem Biol. 2019 Mar 15;14(3):337-341. (PMID: 30715849)
J Med Chem. 2019 Jan 10;62(1):306-316. (PMID: 30207464)
BMC Genomics. 2009 Jul 07;10 Suppl 1:S7. (PMID: 19594884)
J Phys Chem Lett. 2019 Jul 18;10(14):3929-3936. (PMID: 31260322)
J Am Chem Soc. 2017 Nov 15;139(45):16256-16263. (PMID: 29039919)
Nat Biotechnol. 1997 Dec;15(13):1318-9. (PMID: 9415870)
FEBS Lett. 2015 Sep 14;589(19 Pt A):2570-7. (PMID: 26320411)
Drug Discov Today. 2013 Oct;18(19-20):910-5. (PMID: 23643489)
Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Aug 17;107(33):14609-14. (PMID: 20639465)
Angew Chem Int Ed Engl. 2019 Mar 26;58(14):4720-4724. (PMID: 30703278)
EMBO J. 2019 May 15;38(10):. (PMID: 30979777)
Adv Exp Med Biol. 2012;725:1-14. (PMID: 22399315)
Phys Chem Chem Phys. 2014 Apr 14;16(14):6323-31. (PMID: 24317797)
Nat Chem. 2017 Nov;9(11):1118-1125. (PMID: 29064502)
Nucleic Acids Res. 2012 Jan;40(Database issue):D242-51. (PMID: 22110040)
Biophys J. 2010 May 19;98(10):2383-90. (PMID: 20483348)
Protein Sci. 2015 May;24(5):688-705. (PMID: 25611056)
J Am Chem Soc. 2007 May 2;129(17):5656-64. (PMID: 17411046)
PLoS Biol. 2017 Jul 6;15(7):e2002183. (PMID: 28683104)
Mov Disord. 2017 Feb;32(2):211-218. (PMID: 27886407)
Nat Commun. 2018 Nov 9;9(1):4707. (PMID: 30413699)
J Phys Chem B. 2014 Apr 17;118(15):4088-97. (PMID: 24673507)
Proc Natl Acad Sci U S A. 2009 Apr 7;106(14):5645-50. (PMID: 19293380)
Sci Rep. 2017 Jan 05;7:39732. (PMID: 28054562)
PLoS Comput Biol. 2013;9(10):e1003249. (PMID: 24098099)
Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Apr 30;110(18):7270-5. (PMID: 23576739)
Curr Opin Struct Biol. 2013 Feb;23(1):36-47. (PMID: 23312353)
RNA Biol. 2016 Dec;13(12):1228-1231. (PMID: 27791471)
Nature. 2014 Apr 17;508(7496):331-9. (PMID: 24740064)
FEBS Lett. 2015 Sep 14;589(19 Pt A):2433-40. (PMID: 26073260)
Chem Rev. 2014 Jul 9;114(13):6632-60. (PMID: 24725176)
Nat Med. 2009 Jul;15(7):750-6. (PMID: 19584866)
Trends Biochem Sci. 2018 Jul;43(7):499-516. (PMID: 29716768)
Phys Chem Chem Phys. 2019 Mar 6;21(10):5634-5645. (PMID: 30793144)
Mol Cell. 2015 Oct 15;60(2):208-19. (PMID: 26412307)
Trends Biochem Sci. 2001 Oct;26(10):597-604. (PMID: 11590012)
Cell. 2019 Jan 24;176(3):419-434. (PMID: 30682370)
Front Mol Biosci. 2018 Apr 30;5:39. (PMID: 29761107)
Nat Methods. 2015 Dec;12(12):1132-4. (PMID: 26436482)
Annu Rev Phys Chem. 2017 May 5;68:117-134. (PMID: 28226222)
J Am Chem Soc. 2016 Jul 20;138(28):8742-51. (PMID: 27348048)
Biophys J. 2017 Aug 8;113(3):550-557. (PMID: 28793210)
PLoS One. 2015 May 14;10(5):e0126729. (PMID: 25974317)
Nucleic Acids Res. 2014 Jan;42(Database issue):D326-35. (PMID: 24174539)
Biochim Biophys Acta. 2010 Jun;1804(6):1231-64. (PMID: 20117254)
Cell. 2018 Apr 19;173(3):720-734.e15. (PMID: 29677515)
EMBO J. 2017 Oct 16;36(20):2951-2967. (PMID: 28790177)
J Biol Chem. 2014 Apr 11;289(15):10727-37. (PMID: 24567327)
J Biophotonics. 2018 Mar;11(3):. (PMID: 28800386)
EMBO J. 2017 Jun 14;36(12):1669-1687. (PMID: 28377462)
Cell. 2018 Jul 26;174(3):688-699.e16. (PMID: 29961577)
ACS Omega. 2018 Nov 16;3(11):15643-15652. (PMID: 31458221)
Nucleic Acids Res. 2017 Jan 4;45(D1):D228-D235. (PMID: 27794553)
PLoS Biol. 2009 Feb 17;7(2):e34. (PMID: 19226187)
Cell. 1989 Oct 20;59(2):273-82. (PMID: 2478293)
PLoS One. 2014 Feb 14;9(2):e87133. (PMID: 24551051)
Protein Sci. 2014 May;23(5):539-50. (PMID: 24532081)
Cell Commun Signal. 2016 Jan 05;14:1. (PMID: 26727894)
J Phys Chem B. 2015 Jan 29;119(4):1233-42. (PMID: 25517406)
Apoptosis. 2014 Jul;19(7):1055-68. (PMID: 24756955)
Bioinformatics. 2017 Nov 15;33(22):3682-3684. (PMID: 29036655)
Biochim Biophys Acta. 2015 May;1849(5):525-43. (PMID: 24657798)
Chembiochem. 2019 Feb 1;20(3):355-359. (PMID: 30371005)
Nat Biotechnol. 1996 Oct;14(10):1283-7. (PMID: 9631094)
Cell. 2017 Mar 9;168(6):1028-1040.e19. (PMID: 28283059)
Biophys J. 2013 May 7;104(9):1999-2008. (PMID: 23663843)
FEBS J. 2005 Oct;272(20):5129-48. (PMID: 16218947)
Nature. 2018 Mar 1;555(7694):61-66. (PMID: 29466338)
Biophys J. 2017 May 9;112(9):1929-1939. (PMID: 28494963)
PLoS Comput Biol. 2013;9(11):e1003363. (PMID: 24278008)
J Cell Biol. 2006 Mar 13;172(6):803-8. (PMID: 16520386)
Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Apr 16;116(16):7889-7898. (PMID: 30926670)
Trends Biochem Sci. 2008 Jan;33(1):2-8. (PMID: 18054235)
Intrinsically Disord Proteins. 2017 Oct 30;5(1):e1377813. (PMID: 30250773)
J Chem Theory Comput. 2015 Nov 10;11(11):5513-24. (PMID: 26574339)
Acta Neuropathol. 2014;127(6):861-79. (PMID: 24525765)
Chem Rev. 2014 Jul 9;114(13):6661-714. (PMID: 24901537)
Sci Rep. 2015 Jul 03;5:11740. (PMID: 26138206)
Proc Natl Acad Sci U S A. 2005 May 10;102(19):6990-5. (PMID: 15867159)
Cell Rep. 2017 Sep 5;20(10):2304-2312. (PMID: 28877466)
J Biol Chem. 2016 Jan 8;291(2):739-51. (PMID: 26601953)
Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Aug 13;110(33):13392-7. (PMID: 23901099)
Protein Sci. 2004 Jan;13(1):71-80. (PMID: 14691223)
J Mol Evol. 2002 Jul;55(1):104-10. (PMID: 12165847)
Biophys J. 2012 Jan 18;102(2):315-24. (PMID: 22339868)
Nucleic Acids Res. 2018 Jan 4;46(D1):D471-D476. (PMID: 29136219)
Drug Discov Today. 2019 Jan;24(1):217-227. (PMID: 30278223)
RNA Biol. 2009 Jan-Mar;6(1):21-4. (PMID: 19106620)
Nat Rev Mol Cell Biol. 2015 Jan;16(1):18-29. (PMID: 25531225)
Nat Struct Biol. 1996 May;3(5):427-31. (PMID: 8612072)
J Alzheimers Dis. 2016;51(1):165-78. (PMID: 26836184)
J Phys Chem Lett. 2019 Apr 18;10(8):1644-1652. (PMID: 30873835)
Int J Mol Sci. 2019 Jun 11;20(11):. (PMID: 31212691)
J Mol Graph Model. 2001;19(1):26-59. (PMID: 11381529)
Prog Biophys Mol Biol. 2015 Oct;119(1):47-52. (PMID: 25814479)
Trends Biochem Sci. 2010 Oct;35(10):539-46. (PMID: 20541943)
J Am Chem Soc. 2009 Dec 30;131(51):18314-26. (PMID: 20028147)
Nat Commun. 2017 Aug 17;8(1):275. (PMID: 28819146)
Cell Mol Life Sci. 2015 Jan;72(1):137-51. (PMID: 24939692)
J Biol Chem. 2019 Mar 8;294(10):3325-3342. (PMID: 30700558)
J Biol Chem. 2016 Mar 25;291(13):6714-22. (PMID: 26851278)
Substance Nomenclature:
0 (Intrinsically Disordered Proteins)
Entry Date(s):
Date Created: 20200206 Date Completed: 20201008 Latest Revision: 20210217
Update Code:
20240105
PMID:
32020911
Czasopismo naukowe
Intrinsically disordered proteins (IDPs) are highly flexible and undergo disorder to order transition upon binding. They are highly abundant in human proteomes and play critical roles in cell signaling and regulatory processes. This review mainly focuses on the dynamics of disordered proteins including their conformational heterogeneity, protein-protein interactions, and the phase transition of biomolecular condensates that are central to various biological functions. Besides, the role of RNA-mediated chaperones in protein folding and stability of IDPs were also discussed. Finally, we explored the dynamic binding interface of IDPs as novel therapeutic targets and the effect of small molecules on their interactions.

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