Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Przeglądasz jako GOŚĆ
Tytuł pozycji:

Provenance for distributed biomedical workflow execution

Tytuł :
Provenance for distributed biomedical workflow execution
Autorzy :
Madougou, Souley
Santcroos, Mark
Benabdelkader, Ammar
van Schaik, Barbera D. C.
Shahand, Shayan
Korkhov, Vladimir
van Kampen, Antoine H. C.
Olabarriaga, Sílvia D.
Pokaż więcej
Źródło :
Studies in health technology and informatics, 175, 91 - 100. IOS Press
Studies in Health Technology and Informatics, 175, 91 - 100. IOS Press
Rok publikacji :
2012
Język :
English
ISSN :
0926-9630
Numer akcesji :
edsair.dedup.wf.001..e2c41278ace00d4485c6889249e28444
Scientific research has become very data and compute intensive because of the progress in data acquisition and measurement devices, which is particularly true in Life Sciences. To cope with this deluge of data, scientists use distributed computing and storage infrastructures. The use of such infrastructures introduces by itself new challenges to the scientists in terms of proper and efficient use. Scientific workflow management systems play an important role in facilitating the use of the infrastructure by hiding some of its complexity. Although most scientific workflow management systems are provenance-aware, not all of them come with provenance functionality out of the box. In this paper we describe the improvement and integration of a provenance system into an e-infrastructure for biomedical research based on the MOTEUR workflow management system. The main contributions of the paper are: presenting an OPM implementation using relational database backend for the provenance store, providing an e-infrastructure with a comprehensive provenance system, defining a generic approach to provenance implementation, potentially suitable for other workflow systems and application domains and demonstrating the value of this system based on use cases presenting the provenance data through a user-friendly web interface.

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies