A formação inicial de professores de Biologia é historicamente discutida na área da Educação. No entanto, ainda há questões que necessitam ser objeto de reflexão e intervenção, dentre elas a qualidade do ensino de Botânica. Este trabalho objetivou investigar, por meio de uma análise documental, o ensino e o desenvolvimento científico da Botânica em um curso superior público noturno de Licenciatura em Ciências Biológicas. Pretendeu-se identificar entraves e potencialidades para um ensino de Botânica que favoreça aprendizagens significativas a partir da articulação entre teoria e prática. Analisando o Projeto Político Curricular e as produções acadêmicas desenvolvidas entre 2014 e 2021, vinculadas ao trabalho de curso ou a projetos de pesquisa, ensino e extensão, verificou-se que os componentes curriculares de Botânica seguem uma base norteadora conteudista, ocasionando fragilidades no processo de ensino-aprendizagem. Constatou-se também que a indissociabilidade entre pesquisa, ensino, extensão não tem se efetivado plenamente durante a formação docente. Por fim, observou-se que o aprofundamento científico entre os licenciandos tem acontecido superficialmente, especialmente na área da Botânica. Diante desse cenário, sugere-se novos estudos e mudanças que viabilizem um ensino de Botânica de qualidade, bem como impulsionem um maior engajamento dos discentes nesta área, que apresenta relevância científica, social e profissional.