Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Przeglądasz jako GOŚĆ
Tytuł pozycji:

Complete Chloroplast Genomes of 14 Mangroves: Phylogenetic and Comparative Genomic Analyses

Tytuł :
Complete Chloroplast Genomes of 14 Mangroves: Phylogenetic and Comparative Genomic Analyses
Autorzy :
Chengcheng Shi
Kai Han
Liangwei Li
Inge Seim
Simon Ming-Yuen Lee
Xun Xu
Huanming Yang
Guangyi Fan
Xin Liu
Pokaż więcej
Temat :
Medicine
Źródło :
BioMed Research International, Vol 2020 (2020)
Wydawca :
Hindawi Limited, 2020.
Rok publikacji :
2020
Kolekcja :
LCC:Medicine
Typ dokumentu :
article
Opis pliku :
electronic resource
Język :
English
ISSN :
2314-6133
2314-6141
Relacje :
https://doaj.org/toc/2314-6133; https://doaj.org/toc/2314-6141
DOI :
10.1155/2020/8731857
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/2ba8f7a8bdc0447b8a2ab5a85ca80dee
Numer akcesji :
edsdoj.2ba8f7a8bdc0447b8a2ab5a85ca80dee
Czasopismo naukowe
Mangroves are a group of plant species that occupy the coastal intertidal zone and are major components of this ecologically important ecosystem. Mangroves belong to about twenty diverse families. Here, we sequenced and assembled chloroplast genomes of 14 mangrove species from eight families spanning five rosid orders and one asterid order: Fabales (Pongamia pinnata), Lamiales (Avicennia marina), Malpighiales (Excoecaria agallocha, Bruguiera sexangula, Kandelia obovata, Rhizophora stylosa, and Ceriops tagal), Malvales (Hibiscus tiliaceus, Heritiera littoralis, and Thespesia populnea), Myrtales (Laguncularia racemosa, Sonneratia ovata, and Pemphis acidula), and Sapindales (Xylocarpus moluccensis). These chloroplast genomes range from 149 kb to 168 kb in length. A conserved structure of two inverted repeats (IRa and IRb, ~25.8 kb), one large single-copy region (LSC, ~89.0 kb), and one short single-copy region (SSC, ~18.9 kb) as well as ~130 genes (85 protein-coding, 37 tRNAs, and 8 rRNAs) was observed. We found the lowest divergence in the IR regions among the four regions. We also identified simple sequence repeats (SSRs), which were found to be variable in numbers. Most chloroplast genes are highly conserved, with only four genes under positive selection or relaxed pressure. Combined with publicly available chloroplast genomes, we carried out phylogenetic analysis and confirmed the previously reported phylogeny within rosids, including the positioning of obscure families in Malpighiales. Our study reports 14 mangrove chloroplast genomes and illustrates their genome features and evolution.
Zaloguj się, aby uzyskać dostęp do pełnego tekstu.

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies