Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Tytuł pozycji:

The low-copy nuclear gene Agt1 as a novel DNA barcoding marker for Bromeliaceae

Tytuł:
The low-copy nuclear gene Agt1 as a novel DNA barcoding marker for Bromeliaceae
Autorzy:
Fabian Bratzel
Sascha Heller
Nadine Cyrannek
Juraj Paule
Elton M. C. Leme
Anna Loreth
Annika Nowotny
Markus Kiefer
Walter Till
Michael H. J. Barfuss
Christian Lexer
Marcus A. Koch
Georg Zizka
Temat:
DNA barcoding
Low-copy nuclear gene
Plant collections
Bromeliads
Botany
QK1-989
Źródło:
BMC Plant Biology, Vol 20, Iss 1, Pp 1-11 (2020)
Wydawca:
BMC, 2020.
Rok publikacji:
2020
Kolekcja:
LCC:Botany
Typ dokumentu:
article
Opis pliku:
electronic resource
Język:
English
ISSN:
1471-2229
Relacje:
http://link.springer.com/article/10.1186/s12870-020-2326-5; https://doaj.org/toc/1471-2229
DOI:
10.1186/s12870-020-2326-5
Dostęp URL:
https://doaj.org/article/2cc2639b10d945aebe479b0c55edf5fc  Link otwiera się w nowym oknie
Numer akcesji:
edsdoj.2cc2639b10d945aebe479b0c55edf5fc
Czasopismo naukowe
Abstract Background The angiosperm family Bromeliaceae comprises over 3.500 species characterized by exceptionally high morphological and ecological diversity, but a very low genetic variation. In many genera, plants are vegetatively very similar which makes determination of non flowering bromeliads difficult. This is particularly problematic with living collections where plants are often cultivated over decades without flowering. DNA barcoding is therefore a very promising approach to provide reliable and convenient assistance in species determination. However, the observed low genetic variation of canonical barcoding markers in bromeliads causes problems. Result In this study the low-copy nuclear gene Agt1 is identified as a novel DNA barcoding marker suitable for molecular identification of closely related bromeliad species. Combining a comparatively slowly evolving exon sequence with an adjacent, genetically highly variable intron, correctly matching MegaBLAST based species identification rate was found to be approximately double the highest rate yet reported for bromeliads using other barcode markers. Conclusion In the present work, we characterize Agt1 as a novel plant DNA barcoding marker to be used for barcoding of bromeliads, a plant group with low genetic variation. Moreover, we provide a comprehensive marker sequence dataset for further use in the bromeliad research community.
Zaloguj się, aby uzyskać dostęp do pełnego tekstu.

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies