Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Przeglądasz jako GOŚĆ
Tytuł pozycji:

A microsatellite based multiplex PCR method for the detection of chromosomal instability in gastric cancer

Tytuł :
A microsatellite based multiplex PCR method for the detection of chromosomal instability in gastric cancer
Autorzy :
Meike Kohlruss
Magdalena Reiche
Moritz Jesinghaus
Bianca Grosser
Julia Slotta-Huspenina
Alexander Hapfelmeier
Lukas Bauer
Alexander Novotny
Wilko Weichert
Gisela Keller
Pokaż więcej
Temat :
Medicine
Science
Źródło :
Scientific Reports, Vol 8, Iss 1, Pp 1-10 (2018)
Wydawca :
Nature Publishing Group, 2018.
Rok publikacji :
2018
Kolekcja :
LCC:Medicine
LCC:Science
Typ dokumentu :
article
Opis pliku :
electronic resource
Język :
English
ISSN :
2045-2322
Relacje :
http://link.springer.com/article/10.1038/s41598-018-30971-z; https://doaj.org/toc/2045-2322
DOI :
10.1038/s41598-018-30971-z
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/3630d346315b4a39bd1a642cf4585a3d
Numer akcesji :
edsdoj.3630d346315b4a39bd1a642cf4585a3d
Czasopismo naukowe
Abstract Chromosomal instability (CIN) is a hallmark of distinct subclasses of tumours with potential clinical relevance. The aim of our study was to establish a time and cost effective method for the determination of CIN in gastric carcinomas (GC). We developed a microsatellite based multiplex PCR assay for the detection of allelic imbalances (AI) using experimentally defined marker specific threshold values for AI. The assay was tested in 90 formalin-fixed paraffin-embedded GC and results were compared in a subset of 30 carcinomas with the Affymetrix OncoScan assay, which detects copy number variations on genome wide level. The ratios of alterations detected by the two methods demonstrated a significant correlation (r = 0.88). Based on the results of the OncoScan assay, tumours were classified in CIN-High and CIN-Low and a threshold of the AI ratio determined with the PCR assay was defined. Accordingly, 20 of the 90 GC (22%) were CIN-Low and 70 (78%) CIN-High. A significant association of CIN-High was found with intestinal type tumours and proximal tumour localization. In conclusion, we established a PCR based method to categorize AI as surrogate for CIN, which is easy to perform and useful for the clarification of the clinical relevance of CIN in large GC cohorts.
Zaloguj się, aby uzyskać dostęp do pełnego tekstu.

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies