Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Tytuł pozycji:

An Optimized Dual Extraction Method for the Simultaneous and Accurate Analysis of Polar Metabolites and Lipids Carried out on Single Biological Samples

Tytuł:
An Optimized Dual Extraction Method for the Simultaneous and Accurate Analysis of Polar Metabolites and Lipids Carried out on Single Biological Samples
Autorzy:
Joran Villaret-Cazadamont
Nathalie Poupin
Anthony Tournadre
Aurélie Batut
Lara Gales
Daniel Zalko
Nicolas J. Cabaton
Floriant Bellvert
Justine Bertrand-Michel
Temat:
lipidomics
metabolomics
multi-omics analysis
sample preparation
dual extraction
hepatotoxicity
Microbiology
QR1-502
Źródło:
Metabolites, Vol 10, Iss 9, p 338 (2020)
Wydawca:
MDPI AG, 2020.
Rok publikacji:
2020
Kolekcja:
LCC:Microbiology
Typ dokumentu:
article
Opis pliku:
electronic resource
Język:
English
ISSN:
2218-1989
Relacje:
https://www.mdpi.com/2218-1989/10/9/338; https://doaj.org/toc/2218-1989
DOI:
10.3390/metabo10090338
Dostęp URL:
https://doaj.org/article/5bd9ab41d5dd4c7489d50c98ef7bc21f  Link otwiera się w nowym oknie
Numer akcesji:
edsdoj.5bd9ab41d5dd4c7489d50c98ef7bc21f
Czasopismo naukowe
The functional understanding of metabolic changes requires both a significant investigation into metabolic pathways, as enabled by global metabolomics and lipidomics approaches, and the comprehensive and accurate exploration of specific key pathways. To answer this pivotal challenge, we propose an optimized approach, which combines an efficient sample preparation, aiming to reduce the variability, with a biphasic extraction method, where both the aqueous and organic phases of the same sample are used for mass spectrometry analyses. We demonstrated that this double extraction protocol allows working with one single sample without decreasing the metabolome and lipidome coverage. It enables the targeted analysis of 40 polar metabolites and 82 lipids, together with the absolute quantification of 32 polar metabolites, providing comprehensive coverage and quantitative measurement of the metabolites involved in central carbon energy pathways. With this method, we evidenced modulations of several lipids, amino acids, and energy metabolites in HepaRG cells exposed to fenofibrate, a model hepatic toxicant, and metabolic modulator. This new protocol is particularly relevant for experiments involving limited amounts of biological material and for functional metabolic explorations and is thus of particular interest for studies aiming to decipher the effects and modes of action of metabolic disrupting compounds.

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies