Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Przeglądasz jako GOŚĆ
Tytuł pozycji:

Affinity-based proteomics reveals novel binding partners for Rab46 in endothelial cells

Tytuł :
Affinity-based proteomics reveals novel binding partners for Rab46 in endothelial cells
Autorzy :
Lucia Pedicini
Sabina D. Wiktor
Katie J. Simmons
Ashley Money
Lynn McKeown
Pokaż więcej
Temat :
Medicine
Science
Źródło :
Scientific Reports, Vol 11, Iss 1, Pp 1-16 (2021)
Wydawca :
Nature Publishing Group, 2021.
Rok publikacji :
2021
Typ dokumentu :
article
Opis pliku :
electronic resource
Język :
English
ISSN :
2045-2322
Relacje :
https://doaj.org/toc/2045-2322
DOI :
10.1038/s41598-021-83560-y
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/c6b1162121634a90b1082cf02940df59
Numer akcesji :
edsdoj.6b1162121634a90b1082cf02940df59
Czasopismo naukowe
Abstract Rab46 is a novel Ca2+-sensing Rab GTPase shown to have important functions in endothelial and immune cells. The presence of functional Ca2+-binding, coiled-coil and Rab domains suggest that Rab46 will be important for coupling rapid responses to signalling in many cell types. The molecular mechanisms underlying Rab46 function are currently unknown. Here we provide the first resource for studying Rab46 interacting proteins. Using liquid chromatography tandem mass spectrometry (LC–MS/MS) to identify affinity purified proteins that bind to constitutively active GFP-Rab46 or inactive GFP-Rab46 expressed in endothelial cells, we have revealed 922 peptides that interact with either the GTP-bound Rab46 or GDP-bound Rab46. To identify proteins that could be potential Rab46 effectors we performed further comparative analyses between nucleotide-locked Rab46 proteins and identified 29 candidate effector proteins. Importantly, through biochemical and imaging approaches we have validated two potential effector proteins; dynein and the Na2+/ K+ ATPase subunit alpha 1 (ATP1α1). Hence, our use of affinity purification and LC–MS/MS to identify Rab46 neighbouring proteins provides a valuable resource for detecting Rab46 effector proteins and analysing Rab46 functions.
Zaloguj się, aby uzyskać dostęp do pełnego tekstu.

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies