Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Tytuł pozycji:

Lactococcus lactis Diversity Revealed by Targeted Amplicon Sequencing of purR Gene, Metabolic Comparisons and Antimicrobial Properties in an Undefined Mixed Starter Culture Used for Soft-Cheese Manufacture

Tytuł:
Lactococcus lactis Diversity Revealed by Targeted Amplicon Sequencing of purR Gene, Metabolic Comparisons and Antimicrobial Properties in an Undefined Mixed Starter Culture Used for Soft-Cheese Manufacture
Autorzy:
Sabrina Saltaji
Olivier Rué
Valérie Sopena
Sophie Sablé
Fatoumata Tambadou
Sandrine Didelot
Romain Chevrot
Temat:
starter cultures
dairy Lactococcus
carbohydrate metabolism
DADA2 algorithm
antimicrobial activities
lactococcin B-like bacteriocin
Chemical technology
TP1-1185
Źródło:
Foods, Vol 9, Iss 5, p 622 (2020)
Wydawca:
MDPI AG, 2020.
Rok publikacji:
2020
Kolekcja:
LCC:Chemical technology
Typ dokumentu:
article
Opis pliku:
electronic resource
Język:
English
ISSN:
2304-8158
Relacje:
https://www.mdpi.com/2304-8158/9/5/622; https://doaj.org/toc/2304-8158
DOI:
10.3390/foods9050622
Dostęp URL:
https://doaj.org/article/74adb49c2c4f4577b41f8ebdd0331db1  Link otwiera się w nowym oknie
Numer akcesji:
edsdoj.74adb49c2c4f4577b41f8ebdd0331db1
Czasopismo naukowe
The undefined mixed starter culture (UMSC) is used in the manufacture of cheeses. Deciphering UMSC microbial diversity is important to optimize industrial processes. The UMSC was studied using culture-dependent and culture-independent based methods. MALDI-TOF MS enabled identification of species primarily from the Lactococcus genus. Comparisons of carbohydrate metabolism profiles allowed to discriminate five phenotypes of Lactococcus (n = 26/1616). The 16S sequences analysis (V1–V3, V3–V4 regions) clustered the UMSC microbial diversity into two Lactococcus operational taxonomic units (OTUs). These clustering results were improved with the DADA2 algorithm on the housekeeping purR sequences. Five L. lactis variants were detected among the UMSC. The whole-genome sequencing of six isolates allowed for the identification of the lactis subspecies using Illumina® (n = 5) and Pacbio® (n = 1) technologies. Kegg analysis confirmed the L. lactis species-specific niche adaptations and highlighted a progressive gene pseudogenization. Then, agar spot tests and agar well diffusion assays were used to assess UMSC antimicrobial activities. Of note, isolate supernatants (n = 34/1616) were shown to inhibit the growth of Salmonella ser. Typhimurium CIP 104115, Lactobacillus sakei CIP 104494, Staphylococcus aureus DSMZ 13661, Enterococcus faecalis CIP103015 and Listeria innocua CIP 80.11. Collectively, these results provide insightful information about UMSC L. lactis diversity and revealed a potential application as a bio-protective starter culture.

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies