Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Tytuł pozycji:

Deconvolution of RNA-Seq Analysis of Hyperbaric Oxygen-Treated Mice Lungs Reveals Mesenchymal Cell Subtype Changes

Tytuł:
Deconvolution of RNA-Seq Analysis of Hyperbaric Oxygen-Treated Mice Lungs Reveals Mesenchymal Cell Subtype Changes
Autorzy:
Yuan Yuan
Yilu Zhou
Yali Li
Charlotte Hill
Rob M. Ewing
Mark G. Jones
Donna E. Davies
Zhenglin Jiang
Yihua Wang
Temat:
hyperbaric oxygen
lung
rna-seq
cibersortx
Biology (General)
QH301-705.5
Chemistry
QD1-999
Źródło:
International Journal of Molecular Sciences, Vol 21, Iss 4, p 1371 (2020)
Wydawca:
MDPI AG, 2020.
Rok publikacji:
2020
Kolekcja:
LCC:Biology (General)
LCC:Chemistry
Typ dokumentu:
article
Opis pliku:
electronic resource
Język:
English
ISSN:
1422-0067
Relacje:
https://www.mdpi.com/1422-0067/21/4/1371; https://doaj.org/toc/1422-0067
DOI:
10.3390/ijms21041371
Dostęp URL:
https://doaj.org/article/a7af63f3d61f470c8620ec7224e0c2af  Link otwiera się w nowym oknie
Numer akcesji:
edsdoj.7af63f3d61f470c8620ec7224e0c2af
Czasopismo naukowe
Hyperbaric oxygen (HBO) is widely applied to treat several hypoxia-related diseases. Previous studies have focused on the immediate effect of HBO-exposure induced oxidative stress on the lungs, but knowledge regarding the chronic effects from repetitive HBO exposure is limited, especially at the gene expression level. We found that repetitive HBO exposure did not alter the morphology of murine lungs. However, by deconvolution of RNA-seq from those mice lungs using CIBERSORTx and the expression profile matrices of 8 mesenchymal cell subtypes obtained from bleomycin-treated mouse lungs, we identify several mesenchymal cell subtype changes. These include increases in Col13a1 matrix fibroblasts, mesenchymal progenitors and mesothelial cell populations and decreases in lipofibroblasts, endothelial and Pdgfrb high cell populations. Our data suggest that repetitive HBO exposure may affect biological processes in the lungs such as response to wounding, extracellular matrix, vasculature development and immune response.
Zaloguj się, aby uzyskać dostęp do pełnego tekstu.

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies