Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Tytuł pozycji:

Computational Characterizations of the Interactions Between the Pontacyl Violet 6R and Exoribonuclease as a Potential Drug Target Against SARS-CoV-2

Tytuł:
Computational Characterizations of the Interactions Between the Pontacyl Violet 6R and Exoribonuclease as a Potential Drug Target Against SARS-CoV-2
Autorzy:
Rangika Munaweera
Ying S. Hu
Temat:
exoribonuclease
SARS-CoV-2
pontacyl violet 6R
DEDDh exonucleases
RNA-dependent RNA polymerase
orthocoronavirinae
Chemistry
QD1-999
Źródło:
Frontiers in Chemistry, Vol 8 (2021)
Wydawca:
Frontiers Media S.A., 2021.
Rok publikacji:
2021
Kolekcja:
LCC:Chemistry
Typ dokumentu:
article
Opis pliku:
electronic resource
Język:
English
ISSN:
2296-2646
Relacje:
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fchem.2020.627340/full; https://doaj.org/toc/2296-2646
DOI:
10.3389/fchem.2020.627340
Dostęp URL:
https://doaj.org/article/abdf74a09ae240ba84c927038aad26cc  Link otwiera się w nowym oknie
Numer akcesji:
edsdoj.bdf74a09ae240ba84c927038aad26cc
Czasopismo naukowe
We report a molecular-docking and virtual-screening-based identification and characterization of interactions of lead molecules with exoribonuclease (ExoN) enzyme in severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). From previously identified DEDDh/DEEDh subfamily nuclease inhibitors, our results revealed strong binding of pontacyl violet 6R (PV6R) at the catalytic active site of ExoN. The binding was found to be stabilized via two hydrogen bonds and hydrophobic interactions. Molecular dynamics simulations further confirmed the stability of PV6R at the active site showing a shift in ligand to reach a more stabilized binding. Using PV6R as the lead molecule, we employed virtual screening to identify potential molecular candidates that form strong interactions at the ExoN active site. Our study paves ways for evaluating the ExoN as a novel drug target for antiviral treatment against SARS-CoV-2.

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies