Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Tytuł pozycji:

Genotyping of polyploid plants using quantitative PCR: application in the breeding of white-fleshed triploid loquats (Eriobotrya japonica)

Tytuł:
Genotyping of polyploid plants using quantitative PCR: application in the breeding of white-fleshed triploid loquats (Eriobotrya japonica)
Autorzy:
Haiyan Wang
Jiangbo Dang
Di Wu
Zhongyi Xie
Shuang Yan
Jingnan Luo
Qigao Guo
Guolu Liang
Temat:
qPCR genotyping
Polyploid
Flesh color
Allele dosage
Polyploid breeding
Loquat
Plant culture
SB1-1110
Biology (General)
QH301-705.5
Źródło:
Plant Methods, Vol 17, Iss 1, Pp 1-18 (2021)
Wydawca:
BMC, 2021.
Rok publikacji:
2021
Kolekcja:
LCC:Plant culture
LCC:Biology (General)
Typ dokumentu:
article
Opis pliku:
electronic resource
Język:
English
ISSN:
1746-4811
78684900
Relacje:
https://doaj.org/toc/1746-4811
DOI:
10.1186/s13007-021-00792-9
Dostęp URL:
https://doaj.org/article/f617f0cb786849009987222719573620  Link otwiera się w nowym oknie
Numer akcesji:
edsdoj.f617f0cb786849009987222719573620
Czasopismo naukowe
Abstract Background Ploidy manipulation is effective in seedless loquat breeding, in which flesh color is a key agronomic and economic trait. Few techniques are currently available for detecting the genotypes of polyploids in plants, but this ability is essential for most genetic research and molecular breeding. Results We developed a system for genotyping by quantitative PCR (qPCR) that allowed flesh color genotyping in multiple tetraploid and triploid loquat varieties (lines). The analysis of 13 different ratios of DNA mixtures between two homozygous diploids (AA and aa) showed that the proportion of allele A has a high correlation (R2 = 0.9992) with parameter b [b = a1/(a1 + a2)], which is derived from the two normalized allele signals (a1 and a2) provided by qPCR. Cluster analysis and variance analysis from simulating triploid and tetraploid hybrids provided completely correct allelic configurations. Four genotypes (AAA, AAa, Aaa, aaa) were found in triploid loquats, and four (AAAA, AAAa, AAaa, Aaaa; absence of aaaa homozygotes) were found in tetraploid loquats. DNA markers analysis showed that the segregation of flesh color in all F1 hybrids conformed to Mendel's law. When tetraploid B431 was the female parent, more white-fleshed triploids occurred among the progeny. Conclusions qPCR can detect the flesh color genotypes of loquat polyploids and provides an alternative method for analyzing polyploid genotype and breeding, dose effects and allele-specific expression.
Zaloguj się, aby uzyskać dostęp do pełnego tekstu.

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies