Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Przeglądasz jako GOŚĆ
Tytuł pozycji:

Detecting Sources of Transcriptional Heterogeneity in Large-Scale RNA-Seq Data Sets.

Tytuł :
Detecting Sources of Transcriptional Heterogeneity in Large-Scale RNA-Seq Data Sets.
Autorzy :
Searle, Brian C.
Gittelman, Rachel M.
Manor, Ohad
Akey, Joshua M.
Pokaż więcej
Temat :
RNA sequence analysis
PERTURBATION theory
GENETIC transcription
GENE expression
MOLECULAR genetics
GENETIC markers
Źródło :
Genetics. Dec2016, Vol. 204 Issue 4, p1391-1396. 15p.
Czasopismo naukowe
Gene expression levels are dynamic molecular phenotypes that respond to biological, environmental, and technical perturbations. Here we use a novel replicate-classifier approach for discovering transcriptional signatures and apply it to the Genotype- Tissue Expression data set. We identified many factors contributing to expression heterogeneity, such as collection center and ischemia time, and our approach of scoring replicate classifiers allows us to statistically stratify these factors by effect strength. Strikingly, from transcriptional expression in blood alone we detect markers that help predict heart disease and stroke in some patients. Our results illustrate the challenges and opportunities of interpreting patterns of transcriptional variation in large-scale data sets. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
Copyright of Genetics is the property of Genetics Society of America and its content may not be copied or emailed to multiple sites or posted to a listserv without the copyright holder's express written permission. However, users may print, download, or email articles for individual use. This abstract may be abridged. No warranty is given about the accuracy of the copy. Users should refer to the original published version of the material for the full abstract. (Copyright applies to all Abstracts.)

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies