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Tytuł:
Boosting Fitness Costs Associated with Antibiotic Resistance in the Gut: On the Way to Biorestoration of Susceptible Populations.
Autorzy:
Baquero F; Department of Microbiology, Ramón y Cajal University Hospital, Ramón y Cajal Institute for Health Research (IRYCIS), 28034 Madrid, Spain.; Network Center for Biomedical Research in Epidemiology and Public Health (CIBER-ESP), 28029 Madrid, Spain.
Rodríguez-Beltrán J; Department of Microbiology, Ramón y Cajal University Hospital, Ramón y Cajal Institute for Health Research (IRYCIS), 28034 Madrid, Spain.; Network Center for Biomedical Research in Infectious Diseases (CIBER-INFEC), 28034 Madrid, Spain.
Coque TM; Department of Microbiology, Ramón y Cajal University Hospital, Ramón y Cajal Institute for Health Research (IRYCIS), 28034 Madrid, Spain.; Network Center for Biomedical Research in Infectious Diseases (CIBER-INFEC), 28034 Madrid, Spain.
Del Campo R; Department of Microbiology, Ramón y Cajal University Hospital, Ramón y Cajal Institute for Health Research (IRYCIS), 28034 Madrid, Spain.; Network Center for Biomedical Research in Infectious Diseases (CIBER-INFEC), 28034 Madrid, Spain.
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Źródło:
Biomolecules [Biomolecules] 2024 Jan 08; Vol. 14 (1). Date of Electronic Publication: 2024 Jan 08.
Typ publikacji:
Journal Article; Review
MeSH Terms:
Anti-Bacterial Agents*/pharmacology
Sepsis*
Humans ; Anxiety ; Drug Resistance, Microbial ; Exercise
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Tytuł:
What are the missing pieces needed to stop antibiotic resistance?
Autorzy:
Martínez JL; Centro Nacional de Biotecnología, CSIC, Madrid, Spain.
Baquero F; Ramón y Cajal Institute for Health Research (IRYCIS), Department of Microbiology, Ramón y Cajal University Hospital, CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain.
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Źródło:
Microbial biotechnology [Microb Biotechnol] 2023 Oct; Vol. 16 (10), pp. 1900-1923. Date of Electronic Publication: 2023 Jul 07.
Typ publikacji:
Journal Article; Review; Research Support, Non-U.S. Gov't
MeSH Terms:
Drug Resistance, Bacterial*
Anti-Infective Agents*
Humans ; Anti-Bacterial Agents/pharmacology
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Tytuł:
Simulating the efficacy of vaccines on the epidemiological dynamics of SARS-CoV-2 in a membrane computing model.
Autorzy:
Campos M; Department of Microbiology, Ramón y Cajal University Hospital, Ramón y Cajal Institute for Health Research (IRYCIS), M-607, km 9,1 28034 Madrid, Spain.; Valencian Research Institute for Artificial Intelligence (VRAIN), Universitat Politécnica de Valencia, Camí de Vera s/n, 46022 Valencia, Spain.
Sempere JM; Valencian Research Institute for Artificial Intelligence (VRAIN), Universitat Politécnica de Valencia, Camí de Vera s/n, 46022 Valencia, Spain.
Galán JC; Department of Microbiology, Ramón y Cajal University Hospital, Ramón y Cajal Institute for Health Research (IRYCIS), M-607, km 9,1 28034 Madrid, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), M-607, km 9,1. 28034 Madrid, Spain.
Moya A; Foundation for the Promotion of Sanitary and Biomedical Research of the Valencian Community (FISABIO), Av. Cataluña 21, 46020 Valencia, Spain.; Integrative Systems Biology Institute, University of Valencia and Spanish Research Council (CSIC), Av. Cataluña 31, 46020, Valencia, Spain.
Cantón R; Department of Microbiology, Ramón y Cajal University Hospital, Ramón y Cajal Institute for Health Research (IRYCIS), M-607, km 9,1 28034 Madrid, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red Enfermedades Infecciosas (CIBERINFECT), M-607, km 9,1. 28034 Madrid, Spain.
Llorens C; Biotechvana, Valencia, CEEI Building, Valencia Technological Park., C. Agustín Escardino 9, 46980, Paterna, Spain.
Baquero F; Department of Microbiology, Ramón y Cajal University Hospital, Ramón y Cajal Institute for Health Research (IRYCIS), M-607, km 9,1 28034 Madrid, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), M-607, km 9,1. 28034 Madrid, Spain.
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Źródło:
MicroLife [Microlife] 2022 Sep 16; Vol. 3, pp. uqac018. Date of Electronic Publication: 2022 Sep 16 (Print Publication: 2022).
Typ publikacji:
Journal Article
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Tytuł:
Strain-specific predation of Bdellovibrio bacteriovorus on Pseudomonas aeruginosa with a higher range for cystic fibrosis than for bacteremia isolates.
Autorzy:
Saralegui C; Department of Microbiology, Hospital Universitario Ramón Y Cajal, Instituto Ramón Y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), CIBERINFEC, Madrid, Spain.
Herencias C; Department of Microbiology, Hospital Universitario Ramón Y Cajal, Instituto Ramón Y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), CIBERINFEC, Madrid, Spain. .
Halperin AV; Department of Microbiology, Hospital Universitario Ramón Y Cajal, Instituto Ramón Y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), CIBERINFEC, Madrid, Spain.
de Dios-Caballero J; Department of Microbiology, Hospital Universitario Ramón Y Cajal, Instituto Ramón Y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), CIBERINFEC, Madrid, Spain.
Pérez-Viso B; Department of Microbiology, Hospital Universitario Ramón Y Cajal, Instituto Ramón Y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), CIBERINFEC, Madrid, Spain.
Salgado S; Microbial and Plant Biotechnology Department, Biological Research Center-Margarita Salas, CSIC, Ramiro de Maeztu 9, 28040, Madrid, Spain.
Lanza VF; Department of Microbiology, Hospital Universitario Ramón Y Cajal, Instituto Ramón Y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), CIBERINFEC, Madrid, Spain.
Cantón R; Department of Microbiology, Hospital Universitario Ramón Y Cajal, Instituto Ramón Y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), CIBERINFEC, Madrid, Spain.
Baquero F; Department of Microbiology, Hospital Universitario Ramón Y Cajal, Instituto Ramón Y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), CIBERINFEC, Madrid, Spain.; CIBERESP, Madrid, Spain.
Prieto MA; Microbial and Plant Biotechnology Department, Biological Research Center-Margarita Salas, CSIC, Ramiro de Maeztu 9, 28040, Madrid, Spain.
Del Campo R; Department of Microbiology, Hospital Universitario Ramón Y Cajal, Instituto Ramón Y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), CIBERINFEC, Madrid, Spain. .
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Źródło:
Scientific reports [Sci Rep] 2022 Jun 22; Vol. 12 (1), pp. 10523. Date of Electronic Publication: 2022 Jun 22.
Typ publikacji:
Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't
MeSH Terms:
Bacteremia*
Bdellovibrio*/genetics
Bdellovibrio bacteriovorus*/genetics
Cystic Fibrosis*/microbiology
Animals ; Predatory Behavior ; Pseudomonas aeruginosa/genetics
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Tytuł:
Stratified reconstruction of ancestral Escherichia coli diversification.
Autorzy:
Gonzalez-Alba JM; Servicio de Microbiología. Hospital Universitario Ramón y Cajal and Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain.; CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain.
Baquero F; Servicio de Microbiología. Hospital Universitario Ramón y Cajal and Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain.; CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain.; Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia Bacteriana, Madrid, Spain.
Cantón R; Servicio de Microbiología. Hospital Universitario Ramón y Cajal and Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain.; Red Española de Investigación en Patología Infecciosa (REIPI), Madrid, Spain.
Galán JC; Servicio de Microbiología. Hospital Universitario Ramón y Cajal and Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain. .; CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain. .; Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia Bacteriana, Madrid, Spain. .
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Źródło:
BMC genomics [BMC Genomics] 2019 Dec 05; Vol. 20 (1), pp. 936. Date of Electronic Publication: 2019 Dec 05.
Typ publikacji:
Journal Article
MeSH Terms:
Escherichia coli/*classification
Escherichia coli Proteins/*genetics
Genomics/*methods
Databases, Genetic ; Escherichia coli/genetics ; Escherichia coli/pathogenicity ; Evolution, Molecular ; Genome, Bacterial ; Phylogeny ; Virulence Factors/genetics
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Tytuł:
Effect of the different 13-valent pneumococcal conjugate vaccination uptakes on the invasive pneumococcal disease in children: Analysis of a hospital-based and population-based surveillance study in Madrid, Spain, 2007-2015.
Autorzy:
Picazo J; Medicine Department, School of Medicine, Universidad Complutense, Madrid, Spain.
Ruiz-Contreras J; Pediatric Department, Hospital Universitario 12 de Octubre, Madrid, Spain.; Pediatric Department, School of Medicine, Universidad Complutense, Madrid, Spain.
Casado-Flores J; Pediatric ICU, Hospital Universitario Infantil Niño Jesús, Madrid, Spain.; Pediatric Department, School of Medicine, Universidad Autónoma, Madrid, Spain.
Negreira S; Pediatric Department, Hospital Universitario 12 de Octubre, Madrid, Spain.; Pediatric Department, School of Medicine, Universidad Complutense, Madrid, Spain.
Baquero F; Pediatric Department, School of Medicine, Universidad Autónoma, Madrid, Spain.; Pediatric Department, Hospital Universitario La Paz, Madrid, Spain.
Hernández-Sampelayo T; Pediatric Department, School of Medicine, Universidad Complutense, Madrid, Spain.; Pediatric Department, Hospital General Universitario Gregorio Marañón, Madrid, Spain and CIBER of Respiratory Diseases, CIBERES, Madrid, Spain.
Otheo E; Pediatric Department, Hospital Universitario Ramón y Cajal, Madrid, Spain.
Méndez C; Medical Department, Pfizer SLU, Madrid, Spain.
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Corporate Authors:
Heracles Study Group
Źródło:
PloS one [PLoS One] 2017 Feb 16; Vol. 12 (2), pp. e0172222. Date of Electronic Publication: 2017 Feb 16 (Print Publication: 2017).
Typ publikacji:
Journal Article
MeSH Terms:
Pneumococcal Infections/*epidemiology
Pneumococcal Infections/*prevention & control
Pneumococcal Vaccines/*administration & dosage
Pneumococcal Vaccines/*immunology
Streptococcus pneumoniae/*classification
Child, Preschool ; Female ; Heptavalent Pneumococcal Conjugate Vaccine/administration & dosage ; Heptavalent Pneumococcal Conjugate Vaccine/immunology ; Hospitals ; Humans ; Incidence ; Infant ; Infant, Newborn ; Male ; Pneumococcal Infections/microbiology ; Prospective Studies ; Serotyping ; Spain/epidemiology ; Streptococcus pneumoniae/isolation & purification ; Time Factors
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Tytuł:
Genomic and metagenomic technologies to explore the antibiotic resistance mobilome.
Autorzy:
Martínez JL; Centro Nacional de Biotecnología, CSIC, Darwin 3, Madrid, Spain.
Coque TM; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal (IRYCIS), Madrid, Spain.; CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBER-ESP), Madrid, Spain.; Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia Bacteriana (RYC-CSIC), Madrid, Spain.
Lanza VF; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal (IRYCIS), Madrid, Spain.; CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBER-ESP), Madrid, Spain.; Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia Bacteriana (RYC-CSIC), Madrid, Spain.
de la Cruz F; Instituto de Biomedicina y Biotecnología de Cantabria, Universidad de Cantabria-Consejo Superior de Investigaciones Científicas, Santander, Cantabria, Spain.
Baquero F; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal (IRYCIS), Madrid, Spain.; CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBER-ESP), Madrid, Spain.; Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia Bacteriana (RYC-CSIC), Madrid, Spain.
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Źródło:
Annals of the New York Academy of Sciences [Ann N Y Acad Sci] 2017 Jan; Vol. 1388 (1), pp. 26-41. Date of Electronic Publication: 2016 Nov 10.
Typ publikacji:
Journal Article; Review; Research Support, Non-U.S. Gov't
MeSH Terms:
Genome, Bacterial*
Bacteria/*genetics
Computational Biology/*methods
Drug Resistance, Bacterial/*genetics
Metagenomics/*methods
Humans
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Tytuł:
Multiple adaptive routes of Salmonella enterica Typhimurium to biocide and antibiotic exposure.
Autorzy:
Curiao T; Servicio de Microbiología, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain. .; CIBER Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain. .
Marchi E; Department of Agrifood Production and Environmental Sciences, University of Florence, Firenze, Italy.
Grandgirard D; Neuroinfection Laboratory, Institute for Infectious Diseases, Bern, Switzerland.
León-Sampedro R; Servicio de Microbiología, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain.; CIBER Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain.
Viti C; Department of Agrifood Production and Environmental Sciences, University of Florence, Firenze, Italy.
Leib SL; Neuroinfection Laboratory, Institute for Infectious Diseases, Bern, Switzerland.
Baquero F; Servicio de Microbiología, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain.; CIBER Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain.; Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia bacteriana asociada al Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Madrid, Spain.
Oggioni MR; University of Leicester, Leicester, UK.
Martinez JL; Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia bacteriana asociada al Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Madrid, Spain.; Departamento de Biotecnología Microbiana, Centro Nacional de Biotecnología (CSIC), Darwin 3, Cantoblanco, Madrid, 28049, Spain.
Coque TM; Servicio de Microbiología, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain. .; CIBER Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain. .; Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia bacteriana asociada al Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Madrid, Spain. .
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Źródło:
BMC genomics [BMC Genomics] 2016 Jul 13; Vol. 17, pp. 491. Date of Electronic Publication: 2016 Jul 13.
Typ publikacji:
Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't
MeSH Terms:
Adaptation, Biological*
Anti-Bacterial Agents/*pharmacology
Disinfectants/*pharmacology
Salmonella typhimurium/*drug effects
Salmonella typhimurium/*physiology
Cluster Analysis ; Drug Resistance, Bacterial ; Gene Expression Profiling ; Genes, Bacterial ; Genetic Fitness ; Genome, Bacterial ; High-Throughput Nucleotide Sequencing ; Microbial Sensitivity Tests ; Mutation
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Tytuł:
A membrane computing simulator of trans-hierarchical antibiotic resistance evolution dynamics in nested ecological compartments (ARES).
Autorzy:
Campos M; Department of Microbiology, Ramón y Cajal University Hospital, IRYCIS, Carretera de Colmenar Viejo, km. 9,100, 28034, Madrid, Spain. .; Department of Information Systems and Computation (DSIC), Polytechnic University of Valencia, Camino de Vera, 46022, Valencia, Spain. .
Llorens C; Biotechvana, Valencia, CEEI Building, Benjamin Franklin Av. 12, Valencia Technological Park, 46980, Paterna, Spain. .
Sempere JM; Department of Information Systems and Computation (DSIC), Polytechnic University of Valencia, Camino de Vera, 46022, Valencia, Spain. .
Futami R; Biotechvana, Valencia, CEEI Building, Benjamin Franklin Av. 12, Valencia Technological Park, 46980, Paterna, Spain. .
Rodriguez I; Department of Microbiology, Ramón y Cajal University Hospital, IRYCIS, Carretera de Colmenar Viejo, km. 9,100, 28034, Madrid, Spain. .; Antibiotic Resistance and Bacterial Virulence Unit (HRYC-CSIC), associated to the Superior Council of Scientific Investigations (CSIC), Madrid, Spain. .; Network Research Center for Epidemiology and Public Health (CIBER-ESP), Madrid, Spain. .
Carrasco P; Cavanilles Institute of Biodiversity and Evolutionary Biology, University of Valencia, C/ Catedrático José Beltrán 2, 46980, Paterna, Valencia, Spain. .
Capilla R; Biotechvana, Valencia, CEEI Building, Benjamin Franklin Av. 12, Valencia Technological Park, 46980, Paterna, Spain. .
Latorre A; Network Research Center for Epidemiology and Public Health (CIBER-ESP), Madrid, Spain. .; Cavanilles Institute of Biodiversity and Evolutionary Biology, University of Valencia, C/ Catedrático José Beltrán 2, 46980, Paterna, Valencia, Spain. .; Foundation for the Promotion of Health and Biomedical Research in the Valencian Community (FISABIO) - Public Health, Avenida de Cataluña 21, 46020, Valencia, Spain. .
Coque TM; Department of Microbiology, Ramón y Cajal University Hospital, IRYCIS, Carretera de Colmenar Viejo, km. 9,100, 28034, Madrid, Spain. .; Antibiotic Resistance and Bacterial Virulence Unit (HRYC-CSIC), associated to the Superior Council of Scientific Investigations (CSIC), Madrid, Spain. .; Network Research Center for Epidemiology and Public Health (CIBER-ESP), Madrid, Spain. .
Moya A; Network Research Center for Epidemiology and Public Health (CIBER-ESP), Madrid, Spain. .; Cavanilles Institute of Biodiversity and Evolutionary Biology, University of Valencia, C/ Catedrático José Beltrán 2, 46980, Paterna, Valencia, Spain. .; Foundation for the Promotion of Health and Biomedical Research in the Valencian Community (FISABIO) - Public Health, Avenida de Cataluña 21, 46020, Valencia, Spain. .
Baquero F; Department of Microbiology, Ramón y Cajal University Hospital, IRYCIS, Carretera de Colmenar Viejo, km. 9,100, 28034, Madrid, Spain. baquero@bitmailer.net.; Antibiotic Resistance and Bacterial Virulence Unit (HRYC-CSIC), associated to the Superior Council of Scientific Investigations (CSIC), Madrid, Spain. baquero@bitmailer.net.; Network Research Center for Epidemiology and Public Health (CIBER-ESP), Madrid, Spain. baquero@bitmailer.net.
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Źródło:
Biology direct [Biol Direct] 2015 Aug 05; Vol. 10, pp. 41. Date of Electronic Publication: 2015 Aug 05.
Typ publikacji:
Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't
MeSH Terms:
Biological Evolution*
Computer Simulation*
Drug Resistance, Bacterial*
Anti-Bacterial Agents/*pharmacology
Models, Genetic
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Tytuł:
Prioritizing risks of antibiotic resistance genes in all metagenomes.
Autorzy:
Martínez JL; Departamento de Biotecnología Microbiana, Centro Nacional de Biotecnología, Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Darwin 3, Cantoblanco, Madrid Spain; and the Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia Bacteriana asociada al CSIC, Madrid, Spain.
Coque TM; Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia Bacteriana asociada al Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Madrid, Spain; and the Departamento de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid 28034, Spain.
Baquero F; Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia Bacteriana asociada al Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Madrid, Spain; and the Departamento de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid 28034, Spain.
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Źródło:
Nature reviews. Microbiology [Nat Rev Microbiol] 2015 Jun; Vol. 13 (6), pp. 396. Date of Electronic Publication: 2015 Apr 27.
Typ publikacji:
Letter; Comment
MeSH Terms:
Anti-Bacterial Agents/*pharmacology
Bacteria/*genetics
Bacteria/*metabolism
Drug Resistance, Bacterial/*genetics
Animals ; Humans
Opinia redakcyjna
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Tytuł:
Tackling antibiotic resistance: the environmental framework.
Autorzy:
Berendonk TU; 1] Institute for Hydrobiology, Technische Universität Dresden, Dresden 01062, Germany. [2].
Manaia CM; 1] Centro de Biotecnologia e Química Fina - Laboratório Associado, Escola Superior de Biotecnologia, Universidade Católica Portuguesa/Porto, Rua Arquiteto Lobão Vital, Apartado 2511, Porto 4202-401, Portugal. [2].
Merlin C; Université de Lorraine and le Centre National de la Recherche Scientifique, Laboratoire de Chimie Physique et Microbiologie pour l'Environnement, Unite Mixte de Recherche 7564, Vandoeuvre-lès-Nancy F-54500, France.
Fatta-Kassinos D; Civil and Environmental Engineering Department and Nireas, International Water Research Center, University of Cyprus, PO Box 20537, Nicosia 1678, Cyprus.
Cytryn E; Institute of Soil, Water and Environmental Sciences, Volcani Center, Agricultural Research Organization, PO Box 6, Bet Dagan 50250, Israel.
Walsh F; Department of Biology, Biosciences and Electronic Engineering Building, National University of Ireland Maynooth, Maynooth, County Kildare, Ireland.
Bürgmann H; Eawag: Swiss Federal Institute of Aquatic Science and Technology, Department of Surface Waters - Research and Management, Kastanienbaum (LU) 6047, Switzerland.
Sørum H; Norwegian University of Life Sciences, Faculty of Veterinary Medicine and Life Sciences, Department of Food Safety and Infection Biology, PO Box 8146 Dep, Oslo N-0033, Norway.
Norström M; Norwegian Veterinary Institute, Department of Epidemiology, Oslo N-0106, Norway.
Pons MN; Laboratoire Reactions et Génie des Procédés (UMR CNRS 7274), Université de Lorraine, Nancy 54000, France.
Kreuzinger N; Vienna University of Technology, Institute of Water Quality, Resources and Waste Management, Karlsplatz 13/226, Vienna 1040, Austria.
Huovinen P; Department of Medical Microbiology and Immunology, University of Turku, Kiinamyllynkatu 10, 20520 Turku, Finland.
Stefani S; Laboratory of Molecular Microbiology and Antibiotic Resistance, Department of Biomedical Sciences, University of Catania, Via Androne 81, Catania 95124, Italy.
Schwartz T; Karlsruhe Institute of Technology Campus North, Institute of Functional Interfaces, Microbiology of Natural and Technical Interfaces Department, Hermann-von-Helmholtz-Platz 1, Eggenstein-Leopoldshafen 76344, Germany.
Kisand V; Institute of Technology, Tartu University, Nooruse 1, Tartu 50411, Estonia.
Baquero F; Ramón y Cajal Institute for Health Research, Ramón y Cajal University Hospital, Department of Microbiology, Madrid 28034, Spain.
Martinez JL; Departamento de Biotecnologia Microbiana, Centro Nacional de Biotecnologia, Consejo Superior de Investigaciones, Darwin 3, Cantoblanco, Madrid 28049, Spain.
Pokaż więcej
Źródło:
Nature reviews. Microbiology [Nat Rev Microbiol] 2015 May; Vol. 13 (5), pp. 310-7. Date of Electronic Publication: 2015 Mar 30.
Typ publikacji:
Research Support, Non-U.S. Gov't; Review
MeSH Terms:
Health Policy*
Human Activities*
Anti-Bacterial Agents/*pharmacology
Drug Resistance, Bacterial/*drug effects
Drug Resistance, Bacterial/*physiology
Animals ; Environmental Microbiology ; Gene Expression Regulation, Bacterial ; Humans
Recenzja
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Tytuł:
Causes and interventions: need of a multiparametric analysis of microbial ecobiology.
Autorzy:
Baquero F; Department of Microbiology, Ramón y Cajal University Hospital (IRYCIS), Madrid, Spain.
Pokaż więcej
Źródło:
Environmental microbiology reports [Environ Microbiol Rep] 2015 Feb; Vol. 7 (1), pp. 13-4.
Typ publikacji:
Journal Article
MeSH Terms:
Computational Biology*
Bacteria/*chemistry
Bacteria/genetics ; Ecosystem ; Models, Statistical
Czasopismo naukowe
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Tytuł:
What is a resistance gene? Ranking risk in resistomes.
Autorzy:
Martínez JL; Departamento de Biotecnología Microbiana, Centro Nacional de Biotecnología, Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Darwin 3, Cantoblanco,Madrid 28049, Spain; and the Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia Bacteriana asociada al Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Madrid, Spain.
Coque TM; Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia Bacteriana asociada al Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Madrid, Spain; and the Departamento de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid 28034, Spain.
Baquero F; Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia Bacteriana asociada al Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Madrid, Spain; and the Departamento de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid 28034, Spain.
Pokaż więcej
Źródło:
Nature reviews. Microbiology [Nat Rev Microbiol] 2015 Feb; Vol. 13 (2), pp. 116-23. Date of Electronic Publication: 2014 Dec 15.
Typ publikacji:
Research Support, Non-U.S. Gov't; Review
MeSH Terms:
Anti-Bacterial Agents/*pharmacology
Bacteria/*genetics
Bacteria/*metabolism
Drug Resistance, Bacterial/*genetics
Animals ; Bacteria/drug effects ; Bacterial Infections/epidemiology ; Bacterial Infections/microbiology ; Environmental Microbiology ; Gene Expression Regulation, Bacterial ; Gene Transfer, Horizontal ; Humans
Recenzja
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Tytuł:
Recombination blurs phylogenetic groups routine assignment in Escherichia coli: setting the record straight.
Autorzy:
Turrientes MC; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain; CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain.
González-Alba JM; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain; CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain.
del Campo R; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain; Red Española para la Investigación en Enfermedades Infecciosas (REIPI), Madrid, Spain.
Baquero MR; Universidad Alfonso X El Sabio, Villanueva de la Cañada, Madrid, Spain.
Cantón R; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain; Red Española para la Investigación en Enfermedades Infecciosas (REIPI), Madrid, Spain.
Baquero F; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain; CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain.
Galán JC; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain; CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain.
Pokaż więcej
Źródło:
PloS one [PLoS One] 2014 Aug 19; Vol. 9 (8), pp. e105395. Date of Electronic Publication: 2014 Aug 19 (Print Publication: 2014).
Typ publikacji:
Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't
MeSH Terms:
Recombination, Genetic*
Escherichia coli/*genetics
Bayes Theorem ; Evolution, Molecular ; Founder Effect ; Genes, Bacterial ; Models, Genetic ; Multilocus Sequence Typing ; Multiplex Polymerase Chain Reaction ; Phylogeny
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Tytuł:
Emergence and spread of antibiotic resistance: setting a parameter space.
Autorzy:
Martínez JL; Departamento de Biotecnología Microbiana, Centro Nacional de Biotecnología, CSIC , Darwin 3, Cantoblanco, 28049, Madrid , Spain.
Baquero F
Pokaż więcej
Źródło:
Upsala journal of medical sciences [Ups J Med Sci] 2014 May; Vol. 119 (2), pp. 68-77. Date of Electronic Publication: 2014 Mar 30.
Typ publikacji:
Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't; Review
MeSH Terms:
Drug Resistance, Microbial*/genetics
Anti-Bacterial Agents/pharmacology ; Humans
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Tytuł:
Normal mutation rate variants arise in a Mutator (Mut S) Escherichia coli population.
Autorzy:
Turrientes MC; Department of Microbiology, Ramón y Cajal Institute for Health Research, Madrid, Spain ; Centro de Investigación Biomedica en Red de Epidemiología y Salud Pública, Carlos III Health Institute, Madrid, Spain.
Baquero F
Levin BR
Martínez JL
Ripoll A
González-Alba JM
Tobes R
Manrique M
Baquero MR
Rodríguez-Domínguez MJ
Cantón R
Galán JC
Pokaż więcej
Źródło:
PloS one [PLoS One] 2013 Sep 12; Vol. 8 (9), pp. e72963. Date of Electronic Publication: 2013 Sep 12 (Print Publication: 2013).
Typ publikacji:
Journal Article; Research Support, N.I.H., Extramural; Research Support, Non-U.S. Gov't
MeSH Terms:
Escherichia coli/*genetics
Escherichia coli Proteins/genetics ; Evolution, Molecular ; Mutation Rate
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Tytuł:
Screening in a Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus collection to select a strain able to survive to the human intestinal tract.
Autorzy:
Vázquez C; Departamento de Nutrición y Obesidad, y CIBER de Fisiopatología de la Obesidad y Nutrición (CIBERobn), Hospital Universitario Ramón y Cajal y Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain. />Botella-Carretero JI
García-Albiach R
Pozuelo MJ
Rodríguez-Baños M
Baquero F
Baltadjieva MA
del Campo R
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Źródło:
Nutricion hospitalaria [Nutr Hosp] 2013 Jul-Aug; Vol. 28 (4), pp. 1227-35.
Typ publikacji:
Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't
MeSH Terms:
Intestines/*microbiology
Lactobacillus delbrueckii/*physiology
Adult ; Bile Acids and Salts/pharmacology ; Electrophoresis, Polyacrylamide Gel ; Feces/microbiology ; Female ; Genetic Variation ; Humans ; Hydrogen-Ion Concentration ; Lactobacillus delbrueckii/genetics ; Male ; Microbial Sensitivity Tests ; Probiotics ; Real-Time Polymerase Chain Reaction ; Species Specificity ; Yogurt/microbiology
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Tytuł:
Microevolutionary events involving narrow host plasmids influences local fixation of vancomycin-resistance in Enterococcus populations.
Autorzy:
Freitas AR; REQUIMTE, Laboratório de Microbiologia, Faculdade de Farmácia, Universidade do Porto, Porto, Portugal.
Novais C
Tedim AP
Francia MV
Baquero F
Peixe L
Coque TM
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Źródło:
PloS one [PLoS One] 2013; Vol. 8 (3), pp. e60589. Date of Electronic Publication: 2013 Mar 29.
Typ publikacji:
Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't
MeSH Terms:
Vancomycin Resistance*
Anti-Bacterial Agents/*pharmacology
Enterococcus faecium/*drug effects
Gram-Positive Bacterial Infections/*drug therapy
Vancomycin/*pharmacology
DNA Transposable Elements ; DNA, Bacterial/genetics ; Enterococcus faecium/genetics ; Enterococcus faecium/isolation & purification ; Gram-Positive Bacterial Infections/epidemiology ; Humans ; Molecular Sequence Data ; Plasmids/genetics ; Portugal/epidemiology
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Tytuł:
Evolutionary trajectories of beta-lactamase CTX-M-1 cluster enzymes: predicting antibiotic resistance.
Autorzy:
Novais A; Hospital Universitario Ramón y Cajal, IMSALUD, Madrid, Spain.
Comas I
Baquero F
Cantón R
Coque TM
Moya A
González-Candelas F
Galán JC
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Źródło:
PLoS pathogens [PLoS Pathog] 2010 Jan 22; Vol. 6 (1), pp. e1000735. Date of Electronic Publication: 2010 Jan 22.
Typ publikacji:
Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't
MeSH Terms:
Evolution, Molecular*
Phylogeny*
DNA, Bacterial/*genetics
Drug Resistance, Microbial/*genetics
beta-Lactamases/*genetics
Amino Acid Sequence ; Base Sequence ; Models, Genetic ; Molecular Sequence Data ; Mutagenesis, Site-Directed
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Tytuł:
Predictions: evolutionary trajectories and planet medicine.
Autorzy:
Baquero F; Department of Microbiology, The University Hospital Ramón y Cajal in Madrid (Madrid's Institute of Health), CIBERESP Madrid, Spain.
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Źródło:
Microbial biotechnology [Microb Biotechnol] 2009 Mar; Vol. 2 (2), pp. 130-2.
Typ publikacji:
Journal Article
MeSH Terms:
Biological Evolution*
Bacteria/*genetics
Bacteria/drug effects ; Bacteria/metabolism ; Bacterial Infections/drug therapy ; Bacterial Infections/microbiology ; Drug Resistance, Bacterial ; Humans ; Medicine ; Planets ; Selection, Genetic
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