Cross-feeding affects the target of resistance evolution to an antifungal drug.
Autorzy:
Durand R; Département de Biochimie, de Microbiologie et de Bio-informatique, Faculté des Sciences et de Génie, Université Laval, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Canada.; PROTEO, Le regroupement québécois de recherche sur la fonction, l'ingénierie et les applications des protéines, Université Laval, Québec, Canada.; Centre de Recherche sur les Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, Canada.; Département de Biologie, Faculté des Sciences et de Génie, Université Laval, Québec, Canada. Jalbert-Ross J; Département de Biochimie, de Microbiologie et de Bio-informatique, Faculté des Sciences et de Génie, Université Laval, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Canada.; PROTEO, Le regroupement québécois de recherche sur la fonction, l'ingénierie et les applications des protéines, Université Laval, Québec, Canada.; Centre de Recherche sur les Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, Canada. Fijarczyk A; Département de Biochimie, de Microbiologie et de Bio-informatique, Faculté des Sciences et de Génie, Université Laval, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Canada.; PROTEO, Le regroupement québécois de recherche sur la fonction, l'ingénierie et les applications des protéines, Université Laval, Québec, Canada.; Centre de Recherche sur les Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, Canada.; Département de Biologie, Faculté des Sciences et de Génie, Université Laval, Québec, Canada. Dubé AK; Département de Biochimie, de Microbiologie et de Bio-informatique, Faculté des Sciences et de Génie, Université Laval, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Canada.; PROTEO, Le regroupement québécois de recherche sur la fonction, l'ingénierie et les applications des protéines, Université Laval, Québec, Canada.; Centre de Recherche sur les Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, Canada.; Département de Biologie, Faculté des Sciences et de Génie, Université Laval, Québec, Canada. LandryCR; Département de Biochimie, de Microbiologie et de Bio-informatique, Faculté des Sciences et de Génie, Université Laval, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Canada.; PROTEO, Le regroupement québécois de recherche sur la fonction, l'ingénierie et les applications des protéines, Université Laval, Québec, Canada.; Centre de Recherche sur les Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, Canada.; Département de Biologie, Faculté des Sciences et de Génie, Université Laval, Québec, Canada.
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Źródło:
PLoS genetics [PLoS Genet] 2023 Oct 19; Vol. 19 (10), pp. e1011002. Date of Electronic Publication: 2023 Oct 19 (Print Publication: 2023).
Evolutionary trade-off and mutational bias could favor transcriptional over translational divergence within paralog pairs.
Autorzy:
Aubé S; Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Québec, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes, Université Laval, Québec, Québec, Canada.; PROTEO, Le regroupement québécois de recherche sur la fonction, l'ingénierie et les applications des protéines, Université Laval, Québec, Québec, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives, Université Laval, Québec, Québec, Canada. Nielly-Thibault L; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes, Université Laval, Québec, Québec, Canada.; PROTEO, Le regroupement québécois de recherche sur la fonction, l'ingénierie et les applications des protéines, Université Laval, Québec, Québec, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives, Université Laval, Québec, Québec, Canada.; Département de biologie, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Québec, Canada. LandryCR; Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Québec, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes, Université Laval, Québec, Québec, Canada.; PROTEO, Le regroupement québécois de recherche sur la fonction, l'ingénierie et les applications des protéines, Université Laval, Québec, Québec, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives, Université Laval, Québec, Québec, Canada.; Département de biologie, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Québec, Canada.
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Źródło:
PLoS genetics [PLoS Genet] 2023 May 26; Vol. 19 (5), pp. e1010756. Date of Electronic Publication: 2023 May 26 (Print Publication: 2023).
A small protein coded within the mitochondrial canonical gene nd4 regulates mitochondrial bioenergetics.
Autorzy:
Kienzle L; Département de sciences biologiques, Université de Montréal, Montréal, Canada. Bettinazzi S; Département de sciences biologiques, Université de Montréal, Montréal, Canada. Choquette T; Département de sciences biologiques, Université de Montréal, Montréal, Canada. Brunet M; Service de génétique médicale, Département de pédiatrie, Université de Sherbrooke, Sherbrooke, Canada.; Centre de recherche du Centre hospitalier universitaire de Sherbrooke (CRCHUS), Sherbrooke, Canada. Khorami HH; Département de sciences biologiques, Université de Montréal, Montréal, Canada. Jacques JF; Département de biochimie et génomique fonctionnelle, Université de Sherbrooke, Sherbrooke, Canada. Moreau M; Département de biochimie et génomique fonctionnelle, Université de Sherbrooke, Sherbrooke, Canada. Roucou X; Centre de recherche du Centre hospitalier universitaire de Sherbrooke (CRCHUS), Sherbrooke, Canada.; Département de biochimie et génomique fonctionnelle, Université de Sherbrooke, Sherbrooke, Canada. LandryCR; Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Canada.; Institut de biologie intégrative et des systèmes, Université Laval, Québec, Canada.; PROTEO, Le regroupement québécois de recherche sur la fonction, l'ingénierie et les applications des protéines, Université Laval, Québec, Canada.; Centre de recherche sur les données massives, Université Laval, Québec, Canada.; Département de biologie, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Canada. Angers A; Département de sciences biologiques, Université de Montréal, Montréal, Canada. Breton S; Département de sciences biologiques, Université de Montréal, Montréal, Canada. .
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BMC biology [BMC Biol] 2023 May 18; Vol. 21 (1), pp. 111. Date of Electronic Publication: 2023 May 18.
Breaking spore dormancy in budding yeast transforms the cytoplasm and the solubility of the proteome.
Autorzy:
Plante S; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec (Québec), Canada.; Regroupement Québécois de Recherche sur la Fonction, l'Ingénierie et les Applications des Protéines (PROTEO), Université Laval, Québec (Québec), Canada.; Département de biologie, Université Laval, Québec (Québec), Canada.; Département de biochimie, microbiologie et bio-informatique, Université Laval, Québec (Québec), Canada.; Centre de recherche en données massives (CRDM), Université Laval, Québec (Québec), Canada. Moon KM; Department of Biochemistry & Molecular Biology, and Michael Smith Laboratories, University of British Columbia, Vancouver (British Columbia), Canada. Lemieux P; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec (Québec), Canada.; Regroupement Québécois de Recherche sur la Fonction, l'Ingénierie et les Applications des Protéines (PROTEO), Université Laval, Québec (Québec), Canada.; Département de biologie, Université Laval, Québec (Québec), Canada.; Département de biochimie, microbiologie et bio-informatique, Université Laval, Québec (Québec), Canada.; Centre de recherche en données massives (CRDM), Université Laval, Québec (Québec), Canada. Foster LJ; Department of Biochemistry & Molecular Biology, and Michael Smith Laboratories, University of British Columbia, Vancouver (British Columbia), Canada. LandryCR; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec (Québec), Canada.; Regroupement Québécois de Recherche sur la Fonction, l'Ingénierie et les Applications des Protéines (PROTEO), Université Laval, Québec (Québec), Canada.; Département de biologie, Université Laval, Québec (Québec), Canada.; Département de biochimie, microbiologie et bio-informatique, Université Laval, Québec (Québec), Canada.; Centre de recherche en données massives (CRDM), Université Laval, Québec (Québec), Canada.
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Źródło:
PLoS biology [PLoS Biol] 2023 Apr 20; Vol. 21 (4), pp. e3002042. Date of Electronic Publication: 2023 Apr 20 (Print Publication: 2023).
The parasite Schistocephalus solidus secretes proteins with putative host manipulation functions.
Autorzy:
Berger CS; Département de Biologie, Université Laval, Quebec, QC, Canada.; Institut de Biologie Intégrative Et Des Systèmes (IBIS), Université Laval, Quebec, QC, Canada.; Ressources Aquatiques Québec (RAQ), Institut Des Sciences de La Mer de Rimouski, Quebec, Canada. Laroche J; Institut de Biologie Intégrative Et Des Systèmes (IBIS), Université Laval, Quebec, QC, Canada. Maaroufi H; Institut de Biologie Intégrative Et Des Systèmes (IBIS), Université Laval, Quebec, QC, Canada. Martin H; Département de Biologie, Université Laval, Quebec, QC, Canada.; Institut de Biologie Intégrative Et Des Systèmes (IBIS), Université Laval, Quebec, QC, Canada.; Département de Biochimie, Microbiologie Et Bioinformatique, Université Laval, Quebec, QC, Canada. Moon KM; Department of Biochemistry & Molecular Biology, Michael Smith Laboratories, University of British Columbia, Vancouver, V6T 1Z4, Canada. LandryCR; Département de Biologie, Université Laval, Quebec, QC, Canada.; Institut de Biologie Intégrative Et Des Systèmes (IBIS), Université Laval, Quebec, QC, Canada.; Département de Biochimie, Microbiologie Et Bioinformatique, Université Laval, Quebec, QC, Canada.; PROTEO, Le Réseau Québécois de Recherche Sur La Fonction, la structure et l'ingénierie des protéines, Université Laval, Quebec, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Quebec, Canada. Foster LJ; Department of Biochemistry & Molecular Biology, Michael Smith Laboratories, University of British Columbia, Vancouver, V6T 1Z4, Canada. Aubin-Horth N; Département de Biologie, Université Laval, Quebec, QC, Canada. .; Institut de Biologie Intégrative Et Des Systèmes (IBIS), Université Laval, Quebec, QC, Canada. .; Ressources Aquatiques Québec (RAQ), Institut Des Sciences de La Mer de Rimouski, Quebec, Canada. .
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Parasites & vectors [Parasit Vectors] 2021 Aug 28; Vol. 14 (1), pp. 436. Date of Electronic Publication: 2021 Aug 28.
Machine learning approach for discrimination of genotypes based on bright-field cellular images.
Autorzy:
Suzuki G; Artificial Intelligence Research Center, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), Tokyo, 135-0064, Japan. Saito Y; Artificial Intelligence Research Center, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), Tokyo, 135-0064, Japan.; AIST-Waseda University Computational Bio Big-Data Open Innovation Laboratory (CBBD-OIL), Tokyo, 169-8555, Japan.; Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Chiba, 277-8561, Japan. Seki M; Research Center for Advanced Science and Technology, The University of Tokyo, Tokyo, 153-8904, Japan. Evans-Yamamoto D; Research Center for Advanced Science and Technology, The University of Tokyo, Tokyo, 153-8904, Japan.; Institute for Advanced Biosciences, Keio University, Tsuruoka, 997-0035, Japan.; Systems Biology Program, Graduate School of Media and Governance, Keio University, Fujisawa, 252-0882, Japan. Negishi M; Research Center for Advanced Science and Technology, The University of Tokyo, Tokyo, 153-8904, Japan. Kakoi K; Research Center for Advanced Science and Technology, The University of Tokyo, Tokyo, 153-8904, Japan. Kawai H; Research and Development Department, LPIXEL Inc., Tokyo, 100-0004, Japan. LandryCR; Institut de Biologie Intégrative et des Systémes, Université Laval, Québec, QC, G1V 0A6, Canada.; Département de Biochimie, Microbiologie et Bio-informatique, Faculté de sciences et génie, Université Laval, Québec, QC, G1V 0A6, Canada.; PROTEO, le regroupement québécois de recherche sur la fonction, l'ingénierie et les applications des protéines, Université Laval, Québec, QC, G1V 0A6, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, QC, G1V 0A6, Canada.; Département de Biologie, Faculté des sciences et de Génie, Université Laval, Québec, QC, G1V 0A6, Canada. Yachie N; Research Center for Advanced Science and Technology, The University of Tokyo, Tokyo, 153-8904, Japan. .; Institute for Advanced Biosciences, Keio University, Tsuruoka, 997-0035, Japan. .; Systems Biology Program, Graduate School of Media and Governance, Keio University, Fujisawa, 252-0882, Japan. .; School of Biomedical Engineering, The University of British Columbia, Vancouver, V6T1Z3, Canada. . Mitsuyama T; Artificial Intelligence Research Center, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), Tokyo, 135-0064, Japan. .
The Canadian Fungal Research Network: current challenges and future opportunities.
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Horianopoulos LC; Department of Microbiology and Immunology, University of British Columbia, 2185 East Mall, Vancouver, BC V6T 1Z4, Canada. Gluck-Thaler E; Department of Biological Sciences, University of Pittsburgh, 4249 Fifth Avenue, Pittsburgh, PA 15260, USA. Benoit Gelber I; Centre for Structural and Functional Genomics, Department of Biology, Concordia University, 7141 Sherbrooke Street West, Montréal, QC H4B 1R6, Canada. Cowen LE; Department of Molecular Genetics, University of Toronto, 661 University Avenue, Toronto, ON M5G 1M1, Canada. Geddes-McAlister J; Department of Molecular and Cellular Biology, University of Guelph, 474-570 Gordon Street, Guelph, ON N1G 1Y2, Canada. LandryCR; Département de biologie and Département de biochimie, microbiologie et bio-informatique, Université Laval, 1030, avenue de la Médecine, Québec, QC G1V 0A6, Canada. Schwartz IS; Division of Infectious Diseases, Department of Medicine, Faculty of Medicine & Dentistry, University of Alberta, 8440 112 Street NW, Edmonton, AB T6G 2R7, Canada. Scott JA; Dalla Lana School of Public Health, University of Toronto, 223 College Street, Toronto, ON, M5T 1R4, Canada. Sellam A; Department of Microbiology, Infectious Disease and Immunology, Montreal Heart Institute, Université de Montréal, 5000, rue Bélanger, Montréal, QC H1T 1C8, Canada. Sheppard DC; Department of Microbiology and Immunology, McGill University, 3775, rue University, Room 511, Montréal, QC H3A 2B4.; McGill Interdisciplinary Initiative in Infection and Immunity, 3666 McTavish Street, 2nd Floor, Montréal, QC H3Y 1Y2, Canada. Spribille T; Department of Biological Sciences, University of Alberta, 11335 Saskatchewan Drive NW, Edmonton, AB T6G 2H5, Canada. Subramaniam R; Agriculture and Agri-Food Canada, Ottawa Research and Development Centre, 960 Carling Avenue, Ottawa, ON K1A 0C6, Canada. Walker AK; Department of Biology, Acadia University, 33 Westwood Avenue, Room 302, Wolfville, NS B4P 2R6, Canada. Harris SD; Department of Biological Sciences, University of Manitoba, Biological Sciences Building, Winnipeg, MB R3T 2N2, Canada. Shapiro RS; Department of Molecular and Cellular Biology, University of Guelph, 474-570 Gordon Street, Guelph, ON N1G 1Y2, Canada. Gerstein AC; Department of Microbiology, University of Manitoba, 213 Buller Building, Winnipeg, MB R3T 2N2, Canada.; Department of Statistics, University of Manitoba, 318 Machray Hall, Winnipeg, MB R3T 2N2, Canada.
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Źródło:
Canadian journal of microbiology [Can J Microbiol] 2021 Jan; Vol. 67 (1), pp. 13-22. Date of Electronic Publication: 2020 Jul 27.
The Genome Sequence of the Jean-Talon Strain, an Archeological Beer Yeast from Québec, Reveals Traces of Adaptation to Specific Brewing Conditions.
Autorzy:
Fijarczyk A; Département de Biologie, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada .landry@bio.ulaval.ca.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; Département de Biochimie, Microbiologie et Bioinformatique, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; PROTEO, Le réseau québécois de recherche sur la fonction, la structure et l'ingénierie des protéines, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada. Hénault M; Département de Biologie, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; Département de Biochimie, Microbiologie et Bioinformatique, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; PROTEO, Le réseau québécois de recherche sur la fonction, la structure et l'ingénierie des protéines, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada. Marsit S; Département de Biologie, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; Département de Biochimie, Microbiologie et Bioinformatique, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; PROTEO, Le réseau québécois de recherche sur la fonction, la structure et l'ingénierie des protéines, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada. Charron G; Département de Biologie, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; Département de Biochimie, Microbiologie et Bioinformatique, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; PROTEO, Le réseau québécois de recherche sur la fonction, la structure et l'ingénierie des protéines, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada. Fischborn T; Lallemand Inc., Montreal, H1W 2N8 Québec, Canada. Nicole-Labrie L; National Battlefields Commission, Quebec, G1R 2L3, Canada. LandryCR; Département de Biologie, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; Département de Biochimie, Microbiologie et Bioinformatique, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; PROTEO, Le réseau québécois de recherche sur la fonction, la structure et l'ingénierie des protéines, Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, G1V 0A6, Canada.
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Źródło:
G3 (Bethesda, Md.) [G3 (Bethesda)] 2020 Sep 02; Vol. 10 (9), pp. 3087-3097. Date of Electronic Publication: 2020 Sep 02.
Regulation plays a multifaceted role in the retention of gene duplicates.
Autorzy:
Hallin J; Département de biochimie, microbiologie et bio-informatique, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Canada.; Département de biologie, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec, Canada.; PROTEO, Le réseau québécois de recherche sur la fonction, la structure et l'ingénierie des protéines, Université Laval, Québec, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, Canada. LandryCR; Département de biochimie, microbiologie et bio-informatique, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Canada.; Département de biologie, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec, Canada.; PROTEO, Le réseau québécois de recherche sur la fonction, la structure et l'ingénierie des protéines, Université Laval, Québec, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, Canada.
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Źródło:
PLoS biology [PLoS Biol] 2019 Nov 22; Vol. 17 (11), pp. e3000519. Date of Electronic Publication: 2019 Nov 22 (Print Publication: 2019).
Typ publikacji:
Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't; Comment
Paralog dependency indirectly affects the robustness of human cells.
Autorzy:
Dandage R; Département de Biologie, Université Laval, Québec, QC, Canada.; Département de Biochimie, Microbiologie et Bio-Informatique, Université Laval, Québec, QC, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec, QC, Canada.; The Québec Network for Research on Protein Function, Engineering, and Applications (PROTEO), Université Laval, Québec, QC, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, QC, Canada. LandryCR; Département de Biologie, Université Laval, Québec, QC, Canada.; Département de Biochimie, Microbiologie et Bio-Informatique, Université Laval, Québec, QC, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec, QC, Canada.; The Québec Network for Research on Protein Function, Engineering, and Applications (PROTEO), Université Laval, Québec, QC, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, QC, Canada.
Double Selection Enhances the Efficiency of Target-AID and Cas9-Based Genome Editing in Yeast.
Autorzy:
Després PC; Département de Biochimie, Microbiologie et Bio-informatique, Faculté de sciences et genie, Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada.; PROTEO, The Québec Research Network on Protein Function, Structure and Engineering, Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada. Dubé AK; Département de Biochimie, Microbiologie et Bio-informatique, Faculté de sciences et genie, Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada.; PROTEO, The Québec Research Network on Protein Function, Structure and Engineering, Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada.; Département de Biologie, Faculté de sciences et Génie, Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada. Nielly-Thibault L; PROTEO, The Québec Research Network on Protein Function, Structure and Engineering, Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada.; Département de Biologie, Faculté de sciences et Génie, Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada. Yachie N; Research Center for Advanced Science and Technology, Synthetic Biology Division, University of Tokyo, Tokyo, 4-6-1 Komaba, Meguro-ku, 153-8904, Japan.; Department of Biological Sciences, Graduate School of Science, the University of Tokyo, Tokyo, Japan.; Institute for Advanced Biosciences, Keio University, Tsuruoka, Japan.; PRESTO, Japan Science and Technology Agency, Tokyo, Japan. LandryCR; Département de Biochimie, Microbiologie et Bio-informatique, Faculté de sciences et genie, Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada christian.landry@bio.ulaval.ca.; PROTEO, The Québec Research Network on Protein Function, Structure and Engineering, Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada.; Centre de Recherche en Données Massives (CRDM), Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada.; Département de Biologie, Faculté de sciences et Génie, Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada.
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Źródło:
G3 (Bethesda, Md.) [G3 (Bethesda)] 2018 Oct 03; Vol. 8 (10), pp. 3163-3171. Date of Electronic Publication: 2018 Oct 03.
A systems biology approach to explore the impact of maple tree dormancy release on sap variation and maple syrup quality.
Autorzy:
N'guyen GQ; Département des Sciences des aliments, Institut sur la nutrition et les aliments fonctionnels (INAF), Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada.; Département de Biologie, Département de Biochimie, Microbiologie et Bio-informatique, PROTEO, Centre de recherche en données massives and Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada. Martin N; Centre de recherche, de développement et de transfert technologique acéricole Inc., Saint-Norbert-d'Arthabaska, Québec, G0P 1B0, Canada. Jain M; Département de Biologie, Département de Biochimie, Microbiologie et Bio-informatique, PROTEO, Centre de recherche en données massives and Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada. Lagacé L; Centre de recherche, de développement et de transfert technologique acéricole Inc., Saint-Norbert-d'Arthabaska, Québec, G0P 1B0, Canada. LandryCR; Département de Biologie, Département de Biochimie, Microbiologie et Bio-informatique, PROTEO, Centre de recherche en données massives and Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada. Filteau M; Département des Sciences des aliments, Institut sur la nutrition et les aliments fonctionnels (INAF), Université Laval, Québec, Québec, G1V 0A6, Canada. .
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Źródło:
Scientific reports [Sci Rep] 2018 Oct 02; Vol. 8 (1), pp. 14658. Date of Electronic Publication: 2018 Oct 02.
Hybridization and adaptive evolution of diverse Saccharomyces species for cellulosic biofuel production.
Autorzy:
Peris D; Laboratory of Genetics, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, Genome Center of Wisconsin, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA.; DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA. Moriarty RV; Laboratory of Genetics, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, Genome Center of Wisconsin, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA.; DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA. Alexander WG; Laboratory of Genetics, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, Genome Center of Wisconsin, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA.; DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA. Baker E; Laboratory of Genetics, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, Genome Center of Wisconsin, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA.; Microbiology Doctoral Training Program, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA. Sylvester K; Laboratory of Genetics, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, Genome Center of Wisconsin, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA.; DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA. Sardi M; Laboratory of Genetics, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, Genome Center of Wisconsin, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA.; DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA.; Microbiology Doctoral Training Program, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA. Langdon QK; Laboratory of Genetics, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, Genome Center of Wisconsin, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA. Libkind D; Laboratorio de Microbiología Aplicada, Biotecnología y Bioinformática, Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales, IPATEC (CONICET-UNComahue), Centro Regional Universitario Bariloche, Bariloche, Río Negro Argentina. Wang QM; Laboratory of Genetics, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, Genome Center of Wisconsin, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA.; State Key Laboratory of Mycology, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China. Bai FY; State Key Laboratory of Mycology, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China. Leducq JB; Departement des Sciences Biologiques, Université de Montréal, Montreal, QC Canada.; Département de Biologie, PROTEO, Pavillon Charles-Eugène-Marchand, Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Quebec City, QC Canada. Charron G; Département de Biologie, PROTEO, Pavillon Charles-Eugène-Marchand, Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Quebec City, QC Canada. LandryCR; Département de Biologie, PROTEO, Pavillon Charles-Eugène-Marchand, Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Quebec City, QC Canada. Sampaio JP; UCIBIO-REQUIMTE, Departamento de Ciências da Vida, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade Nova de Lisboa, Caparica, Portugal. Gonçalves P; UCIBIO-REQUIMTE, Departamento de Ciências da Vida, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade Nova de Lisboa, Caparica, Portugal. Hyma KE; Department of Genetics, Center for Genome Sciences and Systems Biology, Washington University in St. Louis, St. Louis, MO USA. Fay JC; Department of Genetics, Center for Genome Sciences and Systems Biology, Washington University in St. Louis, St. Louis, MO USA. Sato TK; DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA. Hittinger CT; Laboratory of Genetics, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, Genome Center of Wisconsin, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA.; DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA.; Microbiology Doctoral Training Program, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI USA.
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Źródło:
Biotechnology for biofuels [Biotechnol Biofuels] 2017 Mar 27; Vol. 10, pp. 78. Date of Electronic Publication: 2017 Mar 27 (Print Publication: 2017).
Gene duplication can impart fragility, not robustness, in the yeast protein interaction network.
Autorzy:
Diss G; Département de Biologie, Université Laval, Québec, QC, Canada.; The Quebec Network for Research on Protein Function, Engineering, and Applications, Université Laval, Québec, QC, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes, Université Laval, Québec, QC, Canada.; EMBL/CRG Systems Biology Research Unit, Centre for Genomic Regulation (CRG), The Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), Doctor Aiguader 88, 08003 Barcelona, Spain.; Universitat Pompeu Fabra (UPF), 08003 Barcelona, Spain. Gagnon-Arsenault I; Département de Biologie, Université Laval, Québec, QC, Canada.; The Quebec Network for Research on Protein Function, Engineering, and Applications, Université Laval, Québec, QC, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes, Université Laval, Québec, QC, Canada. Dion-Coté AM; Département de Biologie, Université Laval, Québec, QC, Canada.; The Quebec Network for Research on Protein Function, Engineering, and Applications, Université Laval, Québec, QC, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes, Université Laval, Québec, QC, Canada. Vignaud H; Département de Biologie, Université Laval, Québec, QC, Canada.; The Quebec Network for Research on Protein Function, Engineering, and Applications, Université Laval, Québec, QC, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes, Université Laval, Québec, QC, Canada. Ascencio DI; Département de Biologie, Université Laval, Québec, QC, Canada.; The Quebec Network for Research on Protein Function, Engineering, and Applications, Université Laval, Québec, QC, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes, Université Laval, Québec, QC, Canada.; Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad (LANGEBIO), Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, Irapuato, Guanajuato, Mexico. Berger CM; Département de Biologie, Université Laval, Québec, QC, Canada.; The Quebec Network for Research on Protein Function, Engineering, and Applications, Université Laval, Québec, QC, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes, Université Laval, Québec, QC, Canada. LandryCR; Département de Biologie, Université Laval, Québec, QC, Canada. christian.landry@bio.ulaval.ca.; The Quebec Network for Research on Protein Function, Engineering, and Applications, Université Laval, Québec, QC, Canada.; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes, Université Laval, Québec, QC, Canada.
Complex Ancestries of Lager-Brewing Hybrids Were Shaped by Standing Variation in the Wild Yeast Saccharomyces eubayanus.
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Peris D; Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin, United States of America.; DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin, United States of America. Langdon QK; Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin, United States of America. Moriarty RV; Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin, United States of America.; DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin, United States of America. Sylvester K; Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin, United States of America.; DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin, United States of America. Bontrager M; Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin, United States of America. Charron G; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Département de Biologie, PROTEO, Pavillon Charles-Eugène-Marchand, Université Laval, Québec City, Québec, Canada. Leducq JB; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Département de Biologie, PROTEO, Pavillon Charles-Eugène-Marchand, Université Laval, Québec City, Québec, Canada. LandryCR; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Département de Biologie, PROTEO, Pavillon Charles-Eugène-Marchand, Université Laval, Québec City, Québec, Canada. Libkind D; Laboratorio de Microbiología Aplicada, Biotecnología y Bioinformática, Instituto Andino Patagonico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales, IPATEC (CONICET-UNComahue), Centro Regional Universitario Bariloche, Bariloche, Río Negro, Argentina. Hittinger CT; Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J. F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin, United States of America.; DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin, United States of America.
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Źródło:
PLoS genetics [PLoS Genet] 2016 Jul 06; Vol. 12 (7), pp. e1006155. Date of Electronic Publication: 2016 Jul 06 (Print Publication: 2016).
Typ publikacji:
Journal Article; Research Support, N.I.H., Extramural; Research Support, Non-U.S. Gov't
Transcriptome sequences spanning key developmental states as a resource for the study of the cestode Schistocephalus solidus, a threespine stickleback parasite.
Autorzy:
Hébert FO; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Département de Biologie, Université Laval, Pavillon Charles-Eugène-Marchand, Québec, G1V 0A6, Canada. . Grambauer S; Department of Neuroscience, Psychology and Behaviour, Adrian Building, University of Leicester, University Road, Leicester, LE1 7RH, UK. Barber I; Department of Neuroscience, Psychology and Behaviour, Adrian Building, University of Leicester, University Road, Leicester, LE1 7RH, UK. LandryCR; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Département de Biologie, Université Laval, Pavillon Charles-Eugène-Marchand, Québec, G1V 0A6, Canada. Aubin-Horth N; Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Département de Biologie, Université Laval, Pavillon Charles-Eugène-Marchand, Québec, G1V 0A6, Canada.
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Źródło:
GigaScience [Gigascience] 2016 Jun 02; Vol. 5, pp. 24. Date of Electronic Publication: 2016 Jun 02.
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