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Tytuł :
Assessment of VITEK® MS IVD database V3.0 for identification of Nocardia spp. using two culture media and comparing direct smear and protein extraction procedures
Autorzy :
Durand, T.
Vautrin, F.
Bergeron, E.
Girard, V.
Polsinelli, S.
Monnin, V.
Durand, G.
Dauwalder, O.
Dumitrescu, O.
Laurent, F.
Rodríguez-Nava, V.Aff1, Aff2
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Źródło :
European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. 39(3):559-567
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Microbial risk assessment of Nocardia cyriacigeorgica in polluted environments, case of urban rainfall water.
Autorzy :
Vautrin F; UMR Ecologie Microbienne, CNRS 5557, INRA 1418, Research Team on Bacterial Opportunistic Pathogens and Environment, VetAgro Sup and University, Lyon 1, F-69363 Lyon, France.; UMR LEHNA, CNRS 5023, ENTPE, University Lyon 1, F-69622 Villeurbanne, France.
Pujic P; UMR Ecologie Microbienne, CNRS 5557, INRA 1418, VetAgro Sup and University, Lyon 1, F-69622, Villeurbanne, France.
Paquet C; APCSe, Agressions Pulmonaires et Cardiovasculaires dans le Sepsis, VetAgro Sup - Campus vétérinaire de Lyon, 69280 Marcy l'Etoile, France.
Bergeron E; UMR Ecologie Microbienne, CNRS 5557, INRA 1418, Research Team on Bacterial Opportunistic Pathogens and Environment, VetAgro Sup and University, Lyon 1, F-69363 Lyon, France.
Mouniée D; UMR Ecologie Microbienne, CNRS 5557, INRA 1418, Research Team on Bacterial Opportunistic Pathogens and Environment, VetAgro Sup and University, Lyon 1, F-69363 Lyon, France.
Marchal T; Laboratoire vétérinaire d'histopathologie, VetAgro Sup - Campus vétérinaire de Lyon, 69280 Marcy l'Etoile, France.
Salord H; Observatoire Français des Nocardioses, Institut des Agents Infectieux (IAI), Centre de Biologie et Pathologie Nord, Hôpital de la Croix-Rousse, 69317 Lyon, France.
Bonnet JM; APCSe, Agressions Pulmonaires et Cardiovasculaires dans le Sepsis, VetAgro Sup - Campus vétérinaire de Lyon, 69280 Marcy l'Etoile, France.
Cournoyer B; UMR Ecologie Microbienne, CNRS 5557, INRA 1418, Research Team on Bacterial Opportunistic Pathogens and Environment, VetAgro Sup and University, Lyon 1, F-69363 Lyon, France.
Winiarski T; UMR LEHNA, CNRS 5023, ENTPE, University Lyon 1, F-69622 Villeurbanne, France.
Louzier V; APCSe, Agressions Pulmonaires et Cardiovasculaires dans le Sepsis, VetAgro Sup - Campus vétérinaire de Lyon, 69280 Marcy l'Etoile, France.
Rodriguez-Nava V; UMR Ecologie Microbienne, CNRS 5557, INRA 1418, Research Team on Bacterial Opportunistic Pathogens and Environment, VetAgro Sup and University, Lyon 1, F-69363 Lyon, France.; Observatoire Français des Nocardioses, Institut des Agents Infectieux (IAI), Centre de Biologie et Pathologie Nord, Hôpital de la Croix-Rousse, 69317 Lyon, France.
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Źródło :
Computational and structural biotechnology journal [Comput Struct Biotechnol J] 2020 Dec 29; Vol. 19, pp. 384-400. Date of Electronic Publication: 2020 Dec 29 (Print Publication: 2021).
Typ publikacji :
Journal Article
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Draft genome sequences for three unisolated Alnus -infective Frankia Sp+ strains, AgTrS, AiOr and AvVan, the first sequenced Frankia strains able to sporulate in-planta .
Autorzy :
Bethencourt L; Univ Lyon, Université Lyon 1, CNRS, UMR5557, Ecologie Microbienne, INRA, UMR 1418, 43 bd du 11 novembre 1918, F-69622 Villeurbanne, France.
Vautrin F; Univ Lyon, Université Lyon 1, CNRS, UMR5557, Ecologie Microbienne, INRA, UMR 1418, 43 bd du 11 novembre 1918, F-69622 Villeurbanne, France.
Taib N; Univ Lyon, Université Lyon 1, CNRS, UMR5558, Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive, 43 bd du 11 novembre 1918, F-69622 Villeurbanne, France.
Dubost A; Univ Lyon, Université Lyon 1, CNRS, UMR5557, Ecologie Microbienne, INRA, UMR 1418, 43 bd du 11 novembre 1918, F-69622 Villeurbanne, France.
Castro-Garcia L; Univ Lyon, Université Lyon 1, CNRS, UMR5558, Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive, 43 bd du 11 novembre 1918, F-69622 Villeurbanne, France.
Imbaud O; Univ Lyon, Université Lyon 1, CNRS, UMR5558, Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive, 43 bd du 11 novembre 1918, F-69622 Villeurbanne, France.
Abrouk D; Univ Lyon, Université Lyon 1, CNRS, UMR5557, Ecologie Microbienne, INRA, UMR 1418, 43 bd du 11 novembre 1918, F-69622 Villeurbanne, France.
Fournier P; Univ Lyon, Université Lyon 1, CNRS, UMR5557, Ecologie Microbienne, INRA, UMR 1418, 43 bd du 11 novembre 1918, F-69622 Villeurbanne, France.
Briolay J; Univ Lyon, Université Lyon 1, DTAMB, FR 3728 BioEnviS, 43 bd du 11 novembre 1918, F-69622 Villeurbanne, France.
Nguyen A; Biofidal, 170 av Gabriel Péri, F-69518 Vaulx-en-Velin, France.
Normand P; Univ Lyon, Université Lyon 1, CNRS, UMR5557, Ecologie Microbienne, INRA, UMR 1418, 43 bd du 11 novembre 1918, F-69622 Villeurbanne, France.
Fernandez MP; Univ Lyon, Université Lyon 1, CNRS, UMR5557, Ecologie Microbienne, INRA, UMR 1418, 43 bd du 11 novembre 1918, F-69622 Villeurbanne, France.
Brochier-Armanet C; Univ Lyon, Université Lyon 1, CNRS, UMR5558, Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive, 43 bd du 11 novembre 1918, F-69622 Villeurbanne, France.
Herrera-Belaroussi A; Univ Lyon, Université Lyon 1, CNRS, UMR5557, Ecologie Microbienne, INRA, UMR 1418, 43 bd du 11 novembre 1918, F-69622 Villeurbanne, France.
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Źródło :
Journal of genomics [J Genomics] 2019 Sep 17; Vol. 7, pp. 50-55. Date of Electronic Publication: 2019 Sep 17 (Print Publication: 2019).
Typ publikacji :
Journal Article
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Genome Sequences of Three Nocardia cyriacigeorgica Strains and One Nocardia asteroides Strain.
Autorzy :
Vautrin F; UMR CNRS 5557, INRA 1418 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1, Villeurbanne, France.; Observatoire Français des Nocardioses, Institut des Agents Infectieux (IAI), Centre de Biologie et Pathologie Nord, Hôpital de la Croix-Rousse, Lyon, France.; UMR CNRS 5023, Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés, Vaulx-en-Velin, France.
Bergeron E; UMR CNRS 5557, INRA 1418 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1, Villeurbanne, France.; Observatoire Français des Nocardioses, Institut des Agents Infectieux (IAI), Centre de Biologie et Pathologie Nord, Hôpital de la Croix-Rousse, Lyon, France.
Dubost A; UMR CNRS 5557, INRA 1418 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1, Villeurbanne, France.
Abrouk D; UMR CNRS 5557, INRA 1418 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1, Villeurbanne, France.
Martin C; UMR CNRS 5557, INRA 1418 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1, Villeurbanne, France.
Cournoyer B; UMR CNRS 5557, INRA 1418 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1, Villeurbanne, France.
Louzier V; Agressions Pulmonaires et Circulatoires dans le Sepsis (APCSe), VetAgro Sup-Campus Vétérinaire de Lyon, Marcy l'Etoile, France.
Winiarski T; UMR CNRS 5023, Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés, Vaulx-en-Velin, France.
Rodriguez-Nava V; UMR CNRS 5557, INRA 1418 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1, Villeurbanne, France .; Observatoire Français des Nocardioses, Institut des Agents Infectieux (IAI), Centre de Biologie et Pathologie Nord, Hôpital de la Croix-Rousse, Lyon, France.
Pujic P; UMR CNRS 5557, INRA 1418 Ecologie Microbienne, Université Lyon 1, Villeurbanne, France .
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Źródło :
Microbiology resource announcements [Microbiol Resour Announc] 2019 Aug 15; Vol. 8 (33). Date of Electronic Publication: 2019 Aug 15.
Typ publikacji :
Journal Article
Czasopismo naukowe
Tytuł :
The effects of plant nutritional strategy on soil microbial denitrification activity through rhizosphere primary metabolites.
Autorzy :
Guyonnet JP
Vautrin F
Meiffren G
Labois C
Cantarel AAM
Michalet S
Comte G
Haichar FEZ
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Źródło :
FEMS microbiology ecology [FEMS Microbiol Ecol] 2017 Apr 01; Vol. 93 (4).
Typ publikacji :
Journal Article
MeSH Terms :
Plant Physiological Phenomena*
Rhizosphere*
Soil Microbiology*
Carbon/metabolism ; Denitrification ; Plant Roots/metabolism ; Poaceae/metabolism ; Soil
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Three-dimensional mask effects and source polarization impact on OPC model accuracy and process window.
Autorzy :
Saied, M.
Foussadier, F.
Belledent, J.
Trouiller, Y.
Schanen, I.
Gardin, C.
Urbani, J. C.
Montgomery, P. K.
Sundermann, F.
Robert, F.
Couderc, C.
Vautrin, F.
Kerrien, G.
Planchot, J.
Yesilada, E.
Martinelli, C.
Wilkinson, B.
Borjon, A.
Le-Cam, L.
Di-Maria, J. L.
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Źródło :
Proceedings of SPIE; Nov2007 Part 2, Issue 1, p65204Q-65204Q-12, 12p
Konferencja
Tytuł :
Effect of nitrogen fertilisation on nitrous oxide emission and the abundance of microbial nitrifiers and denitrifiers in the bulk and rhizosphere soil of Solanum lycopersicum and Phaseolus vulgaris.
Autorzy :
Castellano-Hinojosa, Antonio (AUTHOR)
González-López, Jesús (AUTHOR)
Bedmar, Eulogio J. (AUTHOR)
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Źródło :
Plant & Soil. Jun2020, Vol. 451 Issue 1/2, p107-120. 14p. 2 Charts, 4 Graphs.
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Rhizosphere processes in nitrate-rich barley soil tripled both N2O and N2 losses due to enhanced bacterial and fungal denitrification.
Autorzy :
Senbayram, Mehmet (AUTHOR)
Well, Reinhard (AUTHOR)
Shan, Jun (AUTHOR)
Bol, Roland (AUTHOR)
Burkart, Stefan (AUTHOR)
Jones, David L. (AUTHOR)
Wu, Di (AUTHOR)
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Źródło :
Plant & Soil. Mar2020, Vol. 448 Issue 1/2, p509-522. 14p. 1 Color Photograph, 2 Charts, 1 Graph.
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Application of N2-fixing Paenibacillus triticisoli BJ-18 changes the compositions and functions of the bacterial, diazotrophic, and fungal microbiomes in the rhizosphere and root/shoot endosphere of wheat under field conditions
Autorzy :
Li, Yongbin
Wang, Minyang
Chen, Sanfeng
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Źródło :
Biology and Fertility of Soils. 57(3):347-362
Czasopismo naukowe

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