Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Przeglądasz jako GOŚĆ

Wyszukujesz frazę ""accelerated molecular dynamics"" wg kryterium: Temat


Tytuł :
Insights into the molecular mechanism of positive cooperativity between partial agonist MK-8666 and full allosteric agonist AP8 of hGPR40 by Gaussian accelerated molecular dynamics (GaMD) simulations
Autorzy :
Xiaoli An
Qifeng Bai
Zhitong Bing
Huanxiang Liu
Xiaojun Yao
Pokaż więcej
Temat :
hGPR40
Positive binding cooperativity
Partial agonist
AgoPAM
Gaussian accelerated molecular dynamics simulation
Biotechnology
TP248.13-248.65
Źródło :
Computational and Structural Biotechnology Journal, Vol 19, Iss , Pp 3978-3989 (2021)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037021002981; https://doaj.org/toc/2001-0370
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/ef14d48b7d164e7396149f781c96a929
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Hyperdynamics Simulation of the Diffusion of a Vacancy in a Crystal
Autorzy :
Duda, E. V.Aff1, Aff2
Kornich, G. V.
Pokaż więcej
Źródło :
Journal of Surface Investigation: X-ray, Synchrotron and Neutron Techniques. 14(6):1205-1207
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Conformational Changes of Glutamine 5′-Phosphoribosylpyrophosphate Amidotransferase for Two Substrates Analogue Binding: Insight from Conventional Molecular Dynamics and Accelerated Molecular Dynamics Simulations
Autorzy :
Congcong Li
Siao Chen
Tianci Huang
Fangning Zhang
Jiawei Yuan
Hao Chang
Wannan Li
Weiwei Han
Pokaż więcej
Temat :
5′-phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase
substrates analogue
molecular dynamics simulations
accelerated molecular dynamics simulations
conformational changes
Chemistry
QD1-999
Źródło :
Frontiers in Chemistry, Vol 9 (2021)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fchem.2021.640994/full; https://doaj.org/toc/2296-2646
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/4093e915fa124d6080bb05cdebd79a75
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Anti-TNF Alpha Antibody Humira with pH-Dependent Binding Characteristics: A Constant-pH Molecular Dynamics, Gaussian Accelerated Molecular Dynamics, and In Vitro Study
Autorzy :
Shih-Ting Hong
Yu-Cheng Su
Yu-Jen Wang
Tian-Lu Cheng
Yeng-Tseng Wang
Pokaż więcej
Temat :
constant-pH molecular dynamics
molecular simulations
antibody
anti-TNF alpha
Gaussian accelerated molecular dynamics
Microbiology
QR1-502
Źródło :
Biomolecules, Vol 11, Iss 334, p 334 (2021)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
https://www.mdpi.com/2218-273X/11/2/334; https://doaj.org/toc/2218-273X
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/718e4910b4734af2a847d39ec63a7f88
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Laplacian score and genetic algorithm based automatic feature selection for Markov State Models in adaptive sampling based molecular dynamics
Autorzy :
Anu George
Madhura Purnaprajna
Prashanth Athri
Pokaż więcej
Temat :
Molecular Dynamics
Markov State Models
Laplacian scores
Computational Chemistry
Accelerated Molecular Dynamics
Physical and theoretical chemistry
QD450-801
Źródło :
PeerJ Physical Chemistry, Vol 2, p e9 (2020)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
https://peerj.com/articles/pchem-9.pdf; https://peerj.com/articles/pchem-9/; https://doaj.org/toc/2689-7733
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/ce28cd1a097a4ca7ab8bf90cc806fa2f
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Cyclic Peptide Inhibitors of the Tsg101 UEV Protein Interactions Refined through Global Docking and Gaussian Accelerated Molecular Dynamics Simulations
Autorzy :
Wen-Wei Lin
Yu-Jen Wang
Cheng-Wen Ko
Tain-Lu Cheng
Yeng-Tseng Wang
Pokaż więcej
Temat :
molecular dynamics
Tsg101 UEV protein
Gaussian accelerated molecular dynamics simulation
cyclic peptides
Organic chemistry
QD241-441
Źródło :
Polymers, Vol 12, Iss 2235, p 2235 (2020)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
https://www.mdpi.com/2073-4360/12/10/2235; https://doaj.org/toc/2073-4360
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/c331e96e08b74b8a905f696e766499af
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Conformation Transition of Intracellular Part of Glucagon Receptor in Complex With Agonist Glucagon by Conventional and Accelerated Molecular Dynamics Simulations
Autorzy :
Qifeng Bai
Shuoyan Tan
Horacio Pérez-Sánchez
Haixia Feng
Liya Feng
HuanXiang Liu
Xiaojun Yao
Pokaż więcej
Temat :
G-protein-coupled receptors
glucagon receptor
molecular dynamics simulations
accelerated molecular dynamics simulations
conformation transition
Chemistry
QD1-999
Źródło :
Frontiers in Chemistry, Vol 7 (2019)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fchem.2019.00851/full; https://doaj.org/toc/2296-2646
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/d487b97e6abc472b93fc983690a87c22
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Molecular Modeling of Chemosensory Protein 3 from Spodoptera litura and its Binding Property with Plant Defensive Metabolites
Autorzy :
Sujata Singh
Chetna Tyagi
Irfan A. Rather
Jamal S.M. Sabir
Md. Imtaiyaz Hassan
Archana Singh
Indrakant Kumar Singh
Pokaż więcej
Temat :
chemosensory protein 3
DIMBOA
insect–plant interaction
Spodoptera litura
accelerated molecular dynamics
molecular docking
Biology (General)
QH301-705.5
Chemistry
QD1-999
Źródło :
International Journal of Molecular Sciences, Vol 21, Iss 4073, p 4073 (2020)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
https://www.mdpi.com/1422-0067/21/11/4073; https://doaj.org/toc/1661-6596; https://doaj.org/toc/1422-0067
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/26335fcd37384686912d0f83eac24070
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Improved Modeling of Peptide-Protein Binding Through Global Docking and Accelerated Molecular Dynamics Simulations
Autorzy :
Jinan Wang
Andrey Alekseenko
Dima Kozakov
Yinglong Miao
Pokaż więcej
Temat :
peptide-protein binding
peptide docking
PeptiDock
gaussian accelerated molecular dynamics (GaMD)
peptide flexibility
Biology (General)
QH301-705.5
Źródło :
Frontiers in Molecular Biosciences, Vol 6 (2019)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fmolb.2019.00112/full; https://doaj.org/toc/2296-889X
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/9e3aed3fe42d4f378ab6d23c520bb47a
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Exploration of the selective binding mechanism of protein kinase Aurora A selectivity via a comprehensive molecular modeling study
Autorzy :
Zhe Zhang
Yafei Xu
Jian Wu
Ying Shen
Hao Cheng
Yiming Xiang
Pokaż więcej
Temat :
Aurora A
Enhanced simulation
Selective mechanism
Gaussian accelerated Molecular dynamics simulations
Conventional Molecular dynamics simulation
Umbrella sampling simulation
Medicine
Źródło :
PeerJ, Vol 7, p e7832 (2019)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
https://peerj.com/articles/7832.pdf; https://peerj.com/articles/7832/; https://doaj.org/toc/2167-8359
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/1c310665421a43ae9330da53eeb1ed8c
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Accelerated Molecular Dynamics Simulation for Helical Proteins Folding in Explicit Water
Autorzy :
Lili Duan
Xiaona Guo
Yalong Cong
Guoqiang Feng
Yuchen Li
John Z. H. Zhang
Pokaż więcej
Temat :
accelerated molecular dynamics simulation
helical protein
protein folding
explicit water
free energy landscape
Chemistry
QD1-999
Źródło :
Frontiers in Chemistry, Vol 7 (2019)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fchem.2019.00540/full; https://doaj.org/toc/2296-2646
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/80583e0c06fa465698bd7b06ebf7148c
Czasopismo naukowe
Tytuł :
Accelerated Molecular Dynamics Applied to the Peptaibol Folding Problem
Autorzy :
Chetna Tyagi
Tamás Marik
Csaba Vágvölgyi
László Kredics
Ferenc Ötvös
Pokaż więcej
Temat :
accelerated molecular dynamics
alamethicin
membrane
peptaibol
Biology (General)
QH301-705.5
Chemistry
QD1-999
Źródło :
International Journal of Molecular Sciences, Vol 20, Iss 17, p 4268 (2019)
Opis pliku :
electronic resource
Relacje :
https://www.mdpi.com/1422-0067/20/17/4268; https://doaj.org/toc/1422-0067
Dostęp URL :
https://doaj.org/article/2bfa892e78a749caa9f195818378df12
Czasopismo naukowe
Tytuł :
On the construction of a bias potential for atomic system simulation by the hyperdynamics method
Autorzy :
Duda, E. V.
Kornich, G. V.
Pokaż więcej
Źródło :
Journal of Surface Investigation: X-ray, Synchrotron and Neutron Techniques. July 2017 11(4):762-766
Czasopismo naukowe
Tytuł :
VP40 of the Ebola Virus as a Target for EboV Therapy: Comprehensive Conformational and Inhibitor Binding Landscape from Accelerated Molecular Dynamics
Autorzy :
Balmith, Marissa
Soliman, Mahmoud E.S.
Pokaż więcej
Źródło :
Cell Biochemistry and Biophysics. March 2017 75(1):65-78
Czasopismo naukowe

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies