Temat: "bioconductor" - OpacWWW

Skocz do pozycji: 1.

Tytuł:: cageminer: an R/Bioconductor package to prioritize candidate genes by integrating genome-wide association studies and gene coexpression networks.
Autorzy:: Almeida-Silva, Fabricio
Venancio, Thiago M.; Pokaż więcej
Źródło:: In Silico Plants. 2022, Vol. 4 Issue 2, p1-4. 4p.

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Szczegóły

Skocz do pozycji: 2.

Tytuł:: decoupleR: ensemble of computational methods to infer biological activities from omics data.
Autorzy:: Badia-i-Mompel, Pau
Santiago, Jesús Vélez
Braunger, Jana
Geiss, Celina
Dimitrov, Daniel
Müller-Dott, Sophia
Taus, Petr
Dugourd, Aurelien
Holland, Christian H
Flores, Ricardo O Ramirez
Saez-Rodriguez, Julio; Pokaż więcej
Źródło:: Bioinformatics Advances. 2022, Vol. 2 Issue 1, p1-3. 3p.

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Pełny tekst Szczegóły

Skocz do pozycji: 3.

Tytuł:: CTCF: an R/bioconductor data package of human and mouse CTCF binding sites.
Autorzy:: Dozmorov, Mikhail G
Mu, Wancen
Davis, Eric S
Lee, Stuart
Triche, Timothy J
Phanstiel, Douglas H
Love, Michael I; Pokaż więcej
Źródło:: Bioinformatics Advances. 2022, Vol. 2 Issue 1, p1-3. 3p.

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Pełny tekst Szczegóły

Skocz do pozycji: 4.

Tytuł:: Sctensor detects many-to-many cell–cell interactions from single cell RNA-sequencing data
Autorzy:: Tsuyuzaki, KokiAff1, Aff2, IDs1285902305490y_cor1
Ishii, Manabu
Nikaido, ItoshiAff1, Aff3, IDs1285902305490y_cor3; Pokaż więcej
Źródło:: BMC Bioinformatics. 24(1)

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Pełny tekst Szczegóły

Skocz do pozycji: 5.

Tytuł:: Data-driven identification of total RNA expression genes for estimation of RNA abundance in heterogeneous cell types highlighted in brain tissue
Autorzy:: Huuki-Myers, Louise A.
Montgomery, Kelsey D.
Kwon, Sang HoAff1, Aff2
Page, Stephanie C.
Hicks, Stephanie C.
Maynard, Kristen R.Aff1, Aff4, IDs1305902303066w_cor6
Collado-Torres, LeonardoAff1, Aff3, IDs1305902303066w_cor7; Pokaż więcej
Źródło:: Genome Biology. 24(1)

Czasopismo naukowe

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 6.

Tytuł:: BiocMAP: a Bioconductor-friendly, GPU-accelerated pipeline for bisulfite-sequencing data
Autorzy:: Eagles, Nicholas J.
Wilton, Richard
Jaffe, Andrew E.
Collado-Torres, LeonardoAff1, IDs12859023054613_cor4; Pokaż więcej
Źródło:: BMC Bioinformatics. 24(1)

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Pełny tekst Szczegóły

Skocz do pozycji: 7.

Tytuł:: MBECS: Microbiome Batch Effects Correction Suite
Autorzy:: Olbrich, MichaelAff1, Aff2, Aff3, IDs1285902305252w_cor1
Künstner, AxelAff1, Aff2
Busch, HaukeAff1, IDs1285902305252w_cor3; Pokaż więcej
Źródło:: BMC Bioinformatics. 24(1)

Czasopismo naukowe

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 8.

Tytuł:: DNAfusion: an R/Bioconductor package for increased sensitivity of detecting gene fusions in liquid biopsies
Autorzy:: Maansson, Christoffer TrierAff1, Aff2
Andersen, Emma RogerAff1, Aff2
Ulhoi, Maiken ParmAff1, Aff2, Aff3
Meldgaard, PeterAff2, Aff3
Sorensen, Boe SandahlAff1, Aff2, IDs12859023052593_cor5; Pokaż więcej
Źródło:: BMC Bioinformatics. 24(1)

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Pełny tekst Szczegóły

Skocz do pozycji: 9.

Tytuł:: Data-driven identification of total RNA expression genes for estimation of RNA abundance in heterogeneous cell types highlighted in brain tissue
Autorzy:: Louise A. Huuki-Myers
Kelsey D. Montgomery
Sang Ho Kwon
Stephanie C. Page
Stephanie C. Hicks
Kristen R. Maynard
Leonardo Collado-Torres; Pokaż więcej
Temat:: RNA abundance
RNAscope
snRNA-seq
TREG
Deconvolution
Bioconductor
Biology (General)
QH301-705.5
Genetics
QH426-470
Źródło:: Genome Biology, Vol 24, Iss 1, Pp 1-21 (2023)
Opis pliku:: electronic resource
Relacje:: https://doaj.org/toc/1474-760X
Dostęp URL:: https://doaj.org/article/461899ba8b9642eaaa65922cbc7e25e9 Link otwiera się w nowym oknie

Czasopismo naukowe

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 10.

Tytuł:: BiocMAP: a Bioconductor-friendly, GPU-accelerated pipeline for bisulfite-sequencing data
Autorzy:: Nicholas J. Eagles
Richard Wilton
Andrew E. Jaffe
Leonardo Collado-Torres; Pokaż więcej
Temat:: WGBS
Bioconductor
Pipeline
Arioc
Computer applications to medicine. Medical informatics
R858-859.7
Biology (General)
QH301-705.5
Źródło:: BMC Bioinformatics, Vol 24, Iss 1, Pp 1-18 (2023)
Opis pliku:: electronic resource
Relacje:: https://doaj.org/toc/1471-2105
Dostęp URL:: https://doaj.org/article/f2359397a2ee4f7d8e274040c222942d Link otwiera się w nowym oknie

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Pełny tekst Szczegóły

Skocz do pozycji: 11.

Tytuł:: scPipe: A flexible R/Bioconductor preprocessing pipeline for single-cell RNA-sequencing data.
Autorzy:: Tian, Luyi
Su, Shian
Dong, Xueyi
Amann-Zalcenstein, Daniela
Biben, Christine
Seidi, Azadeh
Hilton, Douglas J.
Naik, Shalin H.
Ritchie, Matthew E.; Pokaż więcej
Źródło:: PLoS Computational Biology. 8/10/2018, Vol. 14 Issue 8, p1-15. 15p. 1 Diagram, 2 Charts, 5 Graphs.

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Pełny tekst Szczegóły

Skocz do pozycji: 12.

Tytuł:: beachmat: A Bioconductor C++ API for accessing high-throughput biological data from a variety of R matrix types.
Autorzy:: Lun, Aaron T. L.
Pagès, Hervé
Smith, Mike L.; Pokaż więcej
Źródło:: PLoS Computational Biology. 5/3/2018, Vol. 14 Issue 5, p1-15. 15p. 1 Diagram, 4 Graphs.

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Pełny tekst Szczegóły

Skocz do pozycji: 13.

Tytuł:: MBECS: Microbiome Batch Effects Correction Suite
Autorzy:: Michael Olbrich
Axel Künstner
Hauke Busch; Pokaż więcej
Temat:: Microbiome
Batch effects
R-package
phyloseq
Bioconductor
Computer applications to medicine. Medical informatics
R858-859.7
Biology (General)
QH301-705.5
Źródło:: BMC Bioinformatics, Vol 24, Iss 1, Pp 1-5 (2023)
Opis pliku:: electronic resource
Relacje:: https://doaj.org/toc/1471-2105
Dostęp URL:: https://doaj.org/article/1593e25066c24f1db831c55a64785d80 Link otwiera się w nowym oknie

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Pełny tekst Szczegóły

Skocz do pozycji: 14.

Tytuł:: A Bioconductor workflow for processing, evaluating, and interpreting expression proteomics data [version 1; peer review: 2 approved]
Autorzy:: Lisa M. Breckels
Thomas Krueger
Charlotte Hutchings
Charlotte S. Dawson
Kathryn S. Lilley; Pokaż więcej
Temat:: Bioconductor
QFeatures
proteomics
shotgun proteomics
bottom-up proteomics
differential expression
eng
Medicine
Science
Źródło:: F1000Research, Vol 12 (2023)
Opis pliku:: electronic resource
Relacje:: https://f1000research.com/articles/12-1402/v1; https://doaj.org/toc/2046-1402
Dostęp URL:: https://doaj.org/article/8888ada0ba0141bd95a4e812ae1a0a0c Link otwiera się w nowym oknie

Czasopismo naukowe

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 15.

Tytuł:: DNAfusion: an R/Bioconductor package for increased sensitivity of detecting gene fusions in liquid biopsies
Autorzy:: Christoffer Trier Maansson
Emma Roger Andersen
Maiken Parm Ulhoi
Peter Meldgaard
Boe Sandahl Sorensen; Pokaż więcej
Temat:: Gene fusion
EML4-ALK
R/Bioconductor
Non-small cell lung cancer
Next-generation sequencing
Variant call
Computer applications to medicine. Medical informatics
R858-859.7
Biology (General)
QH301-705.5
Źródło:: BMC Bioinformatics, Vol 24, Iss 1, Pp 1-12 (2023)
Opis pliku:: electronic resource
Relacje:: https://doaj.org/toc/1471-2105
Dostęp URL:: https://doaj.org/article/cc429b21f99f4197bc0eaf3a0f475651 Link otwiera się w nowym oknie

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Pełny tekst Szczegóły

Skocz do pozycji: 16.

Tytuł:: simplifyEnrichment: A Bioconductor Package for Clustering and Visualizing Functional Enrichment Results
Autorzy:: Zuguang Gu
Daniel Hübschmann; Pokaż więcej
Temat:: Functional enrichment
Simplify enrichment
Clustering
R/Bioconductor
Software
Visualization
Biology (General)
QH301-705.5
Źródło:: Genomics, Proteomics & Bioinformatics, Vol 21, Iss 1, Pp 190-202 (2023)
Opis pliku:: electronic resource
Relacje:: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1672022922000730; https://doaj.org/toc/1672-0229
Dostęp URL:: https://doaj.org/article/ab3d07ead567455a81d27a8c811c20aa Link otwiera się w nowym oknie

Czasopismo naukowe

na półce

Szczegóły

Skocz do pozycji: 17.

Tytuł:: RCX—an R package adapting the Cytoscape Exchange format for biological networks.
Autorzy:: Auer, Florian
Kramer, Frank; Pokaż więcej
Źródło:: Bioinformatics Advances. 2022, Vol. 2 Issue 1, p1-2. 2p.

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Pełny tekst Szczegóły

Skocz do pozycji: 18.

Tytuł:: GSAR: Bioconductor package for Gene Set analysis in R.
Autorzy:: Rahmatallah, Yasir
Zybailov, Boris
Emmert-Streib, Frank
Glazko, Galina; Pokaż więcej
Źródło:: BMC Bioinformatics. 1/24/2017, Vol. 18, p1-12. 12p. 6 Diagrams.

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Szczegóły

Skocz do pozycji: 19.

Tytuł:: systemPipeR: NGS workflow and report generation environment.
Autorzy:: Backman, Tyler W. H.
Girke, Thomas; Pokaż więcej
Źródło:: BMC Bioinformatics. 9/20/2016, Vol. 17, p1-8. 8p. 1 Diagram, 1 Chart, 1 Graph.

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Szczegóły

Skocz do pozycji: 20.

Tytuł:: BEclear: Batch Effect Detection and Adjustment in DNA Methylation Data.
Autorzy:: Akulenko, Ruslan
Merl, Markus
Helms, Volkhard; Pokaż więcej
Źródło:: PLoS ONE. 8/25/2016, Vol. 11 Issue 8, p1-17. 17p.

Czasopismo naukowe

na półce

Pełny tekst Szczegóły

Informacja

Wyszukujesz frazę ""bioconductor"" wg kryterium: Temat

Źródło danych

Ogranicz do:

Ogranicz do bazy

Typ dokumentu

Temat

Wydawca

Publikacja

Język

Rok publikacji