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Tytuł:
Identification of the hASCT2-binding domain of the Env ERVWE1/syncytin-1 fusogenic glycoprotein.
Autorzy:
Cheynet V; UMR 2714 CNRS-bioMérieux, IFR128 BioSciences Lyon-Gerland, Ecole Normale Supérieure de Lyon, 69364 Lyon Cedex 07, France. valerie.cheynet@ens-lyon.fr
Oriol G
Mallet F
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Źródło:
Retrovirology [Retrovirology] 2006 Jul 04; Vol. 3, pp. 41. Date of Electronic Publication: 2006 Jul 04.
Typ publikacji:
Journal Article
MeSH Terms:
Amino Acid Transport System ASC/*metabolism
Endogenous Retroviruses/*genetics
Gene Products, env/*chemistry
Gene Products, env/*metabolism
Pregnancy Proteins/*chemistry
Pregnancy Proteins/*metabolism
Cell Fusion ; Cell Line ; Gene Products, env/genetics ; HeLa Cells ; Humans ; Minor Histocompatibility Antigens ; Pregnancy Proteins/genetics ; Receptors, Virus/metabolism
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Tytuł:
A comprehensive hybridization model allows whole HERV transcriptome profiling using high density microarray.
Autorzy:
Becker J; Joint research unit, Hospice Civils de Lyon, bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, 165 Chemin du Grand Revoyet, 69310, Pierre-Benite, France.
Pérot P; Joint research unit, Hospice Civils de Lyon, bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, 165 Chemin du Grand Revoyet, 69310, Pierre-Benite, France.
Cheynet V; Joint research unit, Hospice Civils de Lyon, bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, 165 Chemin du Grand Revoyet, 69310, Pierre-Benite, France.
Oriol G; Joint research unit, Hospice Civils de Lyon, bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, 165 Chemin du Grand Revoyet, 69310, Pierre-Benite, France.
Mugnier N; Bioinformatics Research Department, bioMerieux, 376 Chemin de l'Orme, 69280, Marcy l'Etoile, France.
Mommert M; Joint research unit, Hospice Civils de Lyon, bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, 165 Chemin du Grand Revoyet, 69310, Pierre-Benite, France.; EA 7426 Pathophysiology of Injury-induced Immunosuppression, University of Lyon1-Hospices Civils de Lyon-bioMérieux, Hôpital Edouard Herriot, 5 Place d'Arsonval, 69437, Lyon Cedex 3, France.
Tabone O; EA 7426 Pathophysiology of Injury-induced Immunosuppression, University of Lyon1-Hospices Civils de Lyon-bioMérieux, Hôpital Edouard Herriot, 5 Place d'Arsonval, 69437, Lyon Cedex 3, France.
Textoris J; EA 7426 Pathophysiology of Injury-induced Immunosuppression, University of Lyon1-Hospices Civils de Lyon-bioMérieux, Hôpital Edouard Herriot, 5 Place d'Arsonval, 69437, Lyon Cedex 3, France.
Veyrieras JB; Bioinformatics Research Department, bioMerieux, 376 Chemin de l'Orme, 69280, Marcy l'Etoile, France.
Mallet F; Joint research unit, Hospice Civils de Lyon, bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, 165 Chemin du Grand Revoyet, 69310, Pierre-Benite, France. .; EA 7426 Pathophysiology of Injury-induced Immunosuppression, University of Lyon1-Hospices Civils de Lyon-bioMérieux, Hôpital Edouard Herriot, 5 Place d'Arsonval, 69437, Lyon Cedex 3, France. .
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Źródło:
BMC genomics [BMC Genomics] 2017 Apr 08; Vol. 18 (1), pp. 286. Date of Electronic Publication: 2017 Apr 08.
Typ publikacji:
Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't
MeSH Terms:
Gene Expression Profiling*/methods
Hybridization, Genetic*
Models, Genetic*
Transcriptome*
Endogenous Retroviruses/*genetics
Algorithms ; Cluster Analysis ; Computational Biology/methods ; Databases, Nucleic Acid ; Genetic Loci ; Humans ; Nucleic Acid Hybridization ; Reproducibility of Results ; Workflow
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Tytuł:
Quality control implementation for universal characterization of DNA and RNA viruses in clinical respiratory samples using single metagenomic next-generation sequencing workflow.
Autorzy:
Bal A; Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France.; Univ Lyon, Université Lyon 1, Faculté de Médecine Lyon Est, CIRI, Inserm U1111 CNRS UMR5308, Virpath, Lyon, France.; Centre National de Reference des virus respiratoires France Sud, Hospices Civils de Lyon, 103 Grande-Rue de la Croix Rousse, 69317, Lyon, France.; Laboratoire Commun de Recherche HCL-bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, Pierre-Bénite, France.
Pichon M; Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France.; Univ Lyon, Université Lyon 1, Faculté de Médecine Lyon Est, CIRI, Inserm U1111 CNRS UMR5308, Virpath, Lyon, France.; Centre National de Reference des virus respiratoires France Sud, Hospices Civils de Lyon, 103 Grande-Rue de la Croix Rousse, 69317, Lyon, France.
Picard C; Unité de Biologie des Infections Virales Emergentes, Institut Pasteur, Lyon, France.; CIRI Inserm U1111, CNRS 5308, ENS, UCBL, Faculté de Médecine Lyon Est, Université de Lyon, Lyon, France.
Casalegno JS; Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France.; Univ Lyon, Université Lyon 1, Faculté de Médecine Lyon Est, CIRI, Inserm U1111 CNRS UMR5308, Virpath, Lyon, France.; Centre National de Reference des virus respiratoires France Sud, Hospices Civils de Lyon, 103 Grande-Rue de la Croix Rousse, 69317, Lyon, France.
Valette M; Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France.; Univ Lyon, Université Lyon 1, Faculté de Médecine Lyon Est, CIRI, Inserm U1111 CNRS UMR5308, Virpath, Lyon, France.; Centre National de Reference des virus respiratoires France Sud, Hospices Civils de Lyon, 103 Grande-Rue de la Croix Rousse, 69317, Lyon, France.
Schuffenecker I; Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France.
Billard L; INSERM UMR1078 'Génétique, Génomique Fonctionnelle et Biotechnologies', Axe Microbiota, Univ Brest, Brest, France.
Vallet S; INSERM UMR1078 'Génétique, Génomique Fonctionnelle et Biotechnologies', Axe Microbiota, Univ Brest, Brest, France.; Département de Bactériologie-Virologie, Hygiène et Parasitologie-Mycologie, Pôle de Biologie-Pathologie, Centre Hospitalier Régional et Universitaire de Brest, Hôpital de la Cavale Blanche, Brest, France.
Vilchez G; Laboratoire Commun de Recherche HCL-bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, Pierre-Bénite, France.
Cheynet V; Laboratoire Commun de Recherche HCL-bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, Pierre-Bénite, France.
Oriol G; Laboratoire Commun de Recherche HCL-bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, Pierre-Bénite, France.
Trouillet-Assant S; Laboratoire Commun de Recherche HCL-bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, Pierre-Bénite, France.
Gillet Y; Hospices Civils de Lyon, Urgences pédiatriques, Hôpital Femme Mère Enfant, Bron, France.
Lina B; Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France.; Univ Lyon, Université Lyon 1, Faculté de Médecine Lyon Est, CIRI, Inserm U1111 CNRS UMR5308, Virpath, Lyon, France.; Centre National de Reference des virus respiratoires France Sud, Hospices Civils de Lyon, 103 Grande-Rue de la Croix Rousse, 69317, Lyon, France.
Brengel-Pesce K; Laboratoire Commun de Recherche HCL-bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, Pierre-Bénite, France.
Morfin F; Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France.; Univ Lyon, Université Lyon 1, Faculté de Médecine Lyon Est, CIRI, Inserm U1111 CNRS UMR5308, Virpath, Lyon, France.; Centre National de Reference des virus respiratoires France Sud, Hospices Civils de Lyon, 103 Grande-Rue de la Croix Rousse, 69317, Lyon, France.
Josset L; Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France. .; Univ Lyon, Université Lyon 1, Faculté de Médecine Lyon Est, CIRI, Inserm U1111 CNRS UMR5308, Virpath, Lyon, France. .; Centre National de Reference des virus respiratoires France Sud, Hospices Civils de Lyon, 103 Grande-Rue de la Croix Rousse, 69317, Lyon, France. .
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Źródło:
BMC infectious diseases [BMC Infect Dis] 2018 Oct 29; Vol. 18 (1), pp. 537. Date of Electronic Publication: 2018 Oct 29.
Typ publikacji:
Journal Article
MeSH Terms:
DNA Viruses/*genetics
High-Throughput Nucleotide Sequencing/*standards
Metagenomics/*standards
RNA Viruses/*genetics
Respiratory Tract Infections/*virology
DNA Viruses/isolation & purification ; DNA, Viral/chemistry ; DNA, Viral/isolation & purification ; DNA, Viral/metabolism ; Humans ; Quality Control ; RNA Viruses/isolation & purification ; RNA, Viral/chemistry ; RNA, Viral/isolation & purification ; RNA, Viral/metabolism ; Real-Time Polymerase Chain Reaction ; Respiratory Tract Infections/diagnosis
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Tytuł:
Metagenomic Next-Generation Sequencing Reveals Individual Composition and Dynamics of Anelloviruses during Autologous Stem Cell Transplant Recipient Management.
Autorzy:
Bal A; Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, 69004 Lyon, France. .; Univ Lyon, Université Lyon 1, Faculté de Médecine Lyon Est, CIRI, Inserm U1111 CNRS UMR5308, Virpath, 69372 Lyon, France. .; Laboratoire Commun de Recherche HCL-bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, 69495 Pierre-Bénite, France. .
Sarkozy C; Service d'Hématologie Clinique, Centre Hospitalier Lyon Sud, Pierre-Bénite, 69495 Lyon, France. .
Josset L; Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, 69004 Lyon, France. .; Univ Lyon, Université Lyon 1, Faculté de Médecine Lyon Est, CIRI, Inserm U1111 CNRS UMR5308, Virpath, 69372 Lyon, France. .
Cheynet V; Laboratoire Commun de Recherche HCL-bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, 69495 Pierre-Bénite, France. valerie.cheynet@biomerieux.com.
Oriol G; Laboratoire Commun de Recherche HCL-bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, 69495 Pierre-Bénite, France. .
Becker J; Bioaster, Genomics and Transcriptomics Technological Unit, 69007 Lyon, France. .
Vilchez G; Laboratoire Commun de Recherche HCL-bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, 69495 Pierre-Bénite, France. .
Sesques P; Service d'Hématologie Clinique, Centre Hospitalier Lyon Sud, Pierre-Bénite, 69495 Lyon, France. .
Mallet F; Laboratoire Commun de Recherche HCL-bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, 69495 Pierre-Bénite, France. .
Pachot A; Laboratoire Commun de Recherche HCL-bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, 69495 Pierre-Bénite, France. .
Morfin F; Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, 69004 Lyon, France. .; Univ Lyon, Université Lyon 1, Faculté de Médecine Lyon Est, CIRI, Inserm U1111 CNRS UMR5308, Virpath, 69372 Lyon, France. .
Lina B; Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, 69004 Lyon, France. .; Univ Lyon, Université Lyon 1, Faculté de Médecine Lyon Est, CIRI, Inserm U1111 CNRS UMR5308, Virpath, 69372 Lyon, France. .
Salles G; Service d'Hématologie Clinique, Centre Hospitalier Lyon Sud, Pierre-Bénite, 69495 Lyon, France. .
Reynier F; Bioaster, Genomics and Transcriptomics Technological Unit, 69007 Lyon, France. .
Trouillet-Assant S; Univ Lyon, Université Lyon 1, Faculté de Médecine Lyon Est, CIRI, Inserm U1111 CNRS UMR5308, Virpath, 69372 Lyon, France. .; Laboratoire Commun de Recherche HCL-bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, 69495 Pierre-Bénite, France. .
Brengel-Pesce K; Laboratoire Commun de Recherche HCL-bioMerieux, Centre Hospitalier Lyon Sud, 69495 Pierre-Bénite, France. .
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Źródło:
Viruses [Viruses] 2018 Nov 14; Vol. 10 (11). Date of Electronic Publication: 2018 Nov 14.
Typ publikacji:
Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't
MeSH Terms:
Genetic Variation*
Stem Cell Transplantation*
Transplant Recipients*
Transplantation, Autologous*
Anelloviridae/*isolation & purification
Blood/*virology
DNA Virus Infections/*virology
Anelloviridae/classification ; Anelloviridae/genetics ; Antineoplastic Agents/therapeutic use ; DNA, Viral/chemistry ; DNA, Viral/genetics ; Drug Therapy/methods ; High-Throughput Nucleotide Sequencing ; Humans ; Multiple Myeloma/drug therapy ; Pilot Projects ; Prospective Studies ; Sequence Analysis, DNA
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